Protein–RNA interactions for Protein: O00308

WWP2, NEDD4-like E3 ubiquitin-protein ligase WWP2, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WWP2O00308 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WWP2O00308 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WWP2O00308 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WWP2O00308 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WWP2O00308 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
WWP2O00308 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WWP2O00308 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WWP2O00308 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WWP2O00308 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WWP2O00308 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WWP2O00308 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WWP2O00308 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WWP2O00308 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WWP2O00308 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WWP2O00308 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WWP2O00308 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WWP2O00308 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WWP2O00308 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WWP2O00308 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WWP2O00308 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WWP2O00308 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WWP2O00308 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WWP2O00308 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WWP2O00308 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WWP2O00308 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WWP2O00308 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WWP2O00308 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WWP2O00308 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WWP2O00308 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WWP2O00308 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WWP2O00308 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WWP2O00308 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WWP2O00308 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WWP2O00308 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WWP2O00308 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WWP2O00308 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WWP2O00308 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WWP2O00308 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WWP2O00308 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WWP2O00308 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WWP2O00308 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WWP2O00308 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WWP2O00308 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WWP2O00308 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WWP2O00308 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WWP2O00308 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WWP2O00308 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WWP2O00308 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WWP2O00308 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WWP2O00308 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WWP2O00308 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WWP2O00308 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WWP2O00308 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WWP2O00308 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WWP2O00308 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WWP2O00308 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WWP2O00308 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WWP2O00308 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WWP2O00308 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WWP2O00308 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
WWP2O00308 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WWP2O00308 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WWP2O00308 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WWP2O00308 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WWP2O00308 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WWP2O00308 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WWP2O00308 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WWP2O00308 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WWP2O00308 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
WWP2O00308 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WWP2O00308 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
WWP2O00308 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WWP2O00308 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WWP2O00308 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WWP2O00308 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WWP2O00308 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WWP2O00308 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WWP2O00308 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WWP2O00308 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WWP2O00308 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WWP2O00308 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WWP2O00308 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WWP2O00308 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WWP2O00308 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WWP2O00308 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WWP2O00308 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WWP2O00308 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WWP2O00308 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WWP2O00308 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WWP2O00308 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WWP2O00308 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WWP2O00308 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WWP2O00308 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WWP2O00308 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WWP2O00308 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WWP2O00308 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WWP2O00308 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WWP2O00308 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WWP2O00308 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WWP2O00308 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms