Protein–RNA interactions for Protein: O00233

PSMD9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD9O00233 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD9O00233 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD9O00233 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD9O00233 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD9O00233 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD9O00233 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD9O00233 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD9O00233 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD9O00233 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD9O00233 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD9O00233 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD9O00233 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD9O00233 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD9O00233 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD9O00233 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD9O00233 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD9O00233 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD9O00233 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD9O00233 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD9O00233 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD9O00233 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD9O00233 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD9O00233 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD9O00233 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD9O00233 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD9O00233 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD9O00233 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD9O00233 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD9O00233 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD9O00233 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD9O00233 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD9O00233 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD9O00233 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD9O00233 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD9O00233 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD9O00233 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD9O00233 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD9O00233 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD9O00233 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD9O00233 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD9O00233 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD9O00233 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD9O00233 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD9O00233 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD9O00233 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD9O00233 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD9O00233 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD9O00233 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD9O00233 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms