Protein–RNA interactions for Protein: O00148

DDX39A, ATP-dependent RNA helicase DDX39A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39AO00148 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX39AO00148 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX39AO00148 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX39AO00148 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX39AO00148 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX39AO00148 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX39AO00148 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX39AO00148 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX39AO00148 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DDX39AO00148 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDX39AO00148 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DDX39AO00148 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
DDX39AO00148 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX39AO00148 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX39AO00148 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX39AO00148 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX39AO00148 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX39AO00148 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX39AO00148 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX39AO00148 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX39AO00148 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX39AO00148 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX39AO00148 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX39AO00148 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX39AO00148 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX39AO00148 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX39AO00148 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX39AO00148 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX39AO00148 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX39AO00148 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX39AO00148 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX39AO00148 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX39AO00148 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX39AO00148 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX39AO00148 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX39AO00148 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX39AO00148 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX39AO00148 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX39AO00148 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX39AO00148 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX39AO00148 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX39AO00148 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX39AO00148 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX39AO00148 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX39AO00148 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX39AO00148 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX39AO00148 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX39AO00148 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX39AO00148 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX39AO00148 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX39AO00148 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX39AO00148 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX39AO00148 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX39AO00148 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX39AO00148 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX39AO00148 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX39AO00148 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX39AO00148 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX39AO00148 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX39AO00148 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX39AO00148 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
DDX39AO00148 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX39AO00148 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX39AO00148 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX39AO00148 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX39AO00148 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX39AO00148 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms