Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KT08 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KT08 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KT08 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KT08 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KT08 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KT08 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3KT08 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3KT08 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3KT08 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3KT08 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3KT08 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3KT08 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3KT08 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3KT08 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3KT08 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KT08 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KT08 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KT08 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KT08 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KT08 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KT08 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KT08 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KT08 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3KT08 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3KT08 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3KT08 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3KT08 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3KT08 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3KT08 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3KT08 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3KT08 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3KT08 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KT08 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KT08 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KT08 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KT08 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3KT08 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3KT08 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3KT08 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3KT08 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3KT08 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3KT08 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3KT08 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3KT08 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3KT08 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3KT08 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3KT08 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3KT08 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3KT08 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3KT08 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3KT08 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
J3KT08 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
J3KT08 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
J3KT08 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3KT08 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3KT08 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3KT08 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3KT08 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3KT08 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
J3KT08 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3KT08 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3KT08 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3KT08 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3KT08 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3KT08 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3KT08 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3KT08 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3KT08 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KT08 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KT08 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KT08 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KT08 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KT08 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KT08 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KT08 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KT08 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KT08 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KT08 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KT08 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KT08 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KT08 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KT08 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KT08 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KT08 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KT08 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KT08 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KT08 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KT08 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KT08 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KT08 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KT08 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KT08 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KT08 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KT08 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KT08 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KT08 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KT08 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KT08 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KT08 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms