Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LMO7DNF2Z398 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMO7DNF2Z398 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMO7DNF2Z398 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMO7DNF2Z398 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMO7DNF2Z398 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMO7DNF2Z398 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMO7DNF2Z398 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMO7DNF2Z398 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO7DNF2Z398 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO7DNF2Z398 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO7DNF2Z398 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO7DNF2Z398 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO7DNF2Z398 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO7DNF2Z398 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7DNF2Z398 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7DNF2Z398 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7DNF2Z398 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO7DNF2Z398 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO7DNF2Z398 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO7DNF2Z398 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7DNF2Z398 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7DNF2Z398 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7DNF2Z398 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7DNF2Z398 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMO7DNF2Z398 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO7DNF2Z398 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO7DNF2Z398 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO7DNF2Z398 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO7DNF2Z398 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO7DNF2Z398 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO7DNF2Z398 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7DNF2Z398 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7DNF2Z398 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMO7DNF2Z398 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMO7DNF2Z398 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO7DNF2Z398 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO7DNF2Z398 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO7DNF2Z398 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO7DNF2Z398 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO7DNF2Z398 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO7DNF2Z398 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO7DNF2Z398 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO7DNF2Z398 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO7DNF2Z398 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO7DNF2Z398 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO7DNF2Z398 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO7DNF2Z398 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO7DNF2Z398 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO7DNF2Z398 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMO7DNF2Z398 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO7DNF2Z398 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO7DNF2Z398 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO7DNF2Z398 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO7DNF2Z398 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO7DNF2Z398 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO7DNF2Z398 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO7DNF2Z398 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO7DNF2Z398 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO7DNF2Z398 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7DNF2Z398 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7DNF2Z398 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO7DNF2Z398 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO7DNF2Z398 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO7DNF2Z398 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO7DNF2Z398 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms