Protein–RNA interactions for Protein: E9PIF3

NPIPA2, Nuclear pore complex-interacting protein family member A2, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA2E9PIF3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPA2E9PIF3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NPIPA2E9PIF3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA2E9PIF3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA2E9PIF3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA2E9PIF3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA2E9PIF3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA2E9PIF3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPA2E9PIF3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPA2E9PIF3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPA2E9PIF3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPA2E9PIF3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPA2E9PIF3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPA2E9PIF3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPA2E9PIF3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPA2E9PIF3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPA2E9PIF3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPA2E9PIF3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPA2E9PIF3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPA2E9PIF3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPA2E9PIF3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPA2E9PIF3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPA2E9PIF3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPA2E9PIF3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPA2E9PIF3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPA2E9PIF3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPA2E9PIF3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPA2E9PIF3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPA2E9PIF3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPA2E9PIF3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPA2E9PIF3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPA2E9PIF3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPA2E9PIF3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPA2E9PIF3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPA2E9PIF3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPA2E9PIF3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPA2E9PIF3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPA2E9PIF3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPA2E9PIF3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPA2E9PIF3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms