Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IQCJ-SCHIP1C9J366 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
IQCJ-SCHIP1C9J366 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IQCJ-SCHIP1C9J366 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IQCJ-SCHIP1C9J366 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IQCJ-SCHIP1C9J366 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IQCJ-SCHIP1C9J366 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IQCJ-SCHIP1C9J366 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IQCJ-SCHIP1C9J366 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IQCJ-SCHIP1C9J366 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IQCJ-SCHIP1C9J366 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IQCJ-SCHIP1C9J366 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IQCJ-SCHIP1C9J366 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IQCJ-SCHIP1C9J366 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IQCJ-SCHIP1C9J366 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IQCJ-SCHIP1C9J366 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms