Protein–RNA interactions for Protein: B4DJY2

TMEM233, Transmembrane protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM233B4DJY2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM233B4DJY2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM233B4DJY2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM233B4DJY2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM233B4DJY2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM233B4DJY2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM233B4DJY2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM233B4DJY2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM233B4DJY2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM233B4DJY2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM233B4DJY2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM233B4DJY2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM233B4DJY2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM233B4DJY2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM233B4DJY2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM233B4DJY2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM233B4DJY2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM233B4DJY2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM233B4DJY2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM233B4DJY2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM233B4DJY2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM233B4DJY2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM233B4DJY2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM233B4DJY2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM233B4DJY2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM233B4DJY2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM233B4DJY2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM233B4DJY2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM233B4DJY2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM233B4DJY2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM233B4DJY2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM233B4DJY2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM233B4DJY2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM233B4DJY2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM233B4DJY2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM233B4DJY2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM233B4DJY2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM233B4DJY2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM233B4DJY2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM233B4DJY2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM233B4DJY2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM233B4DJY2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM233B4DJY2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM233B4DJY2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM233B4DJY2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM233B4DJY2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM233B4DJY2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM233B4DJY2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM233B4DJY2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM233B4DJY2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM233B4DJY2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM233B4DJY2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM233B4DJY2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM233B4DJY2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM233B4DJY2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM233B4DJY2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM233B4DJY2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM233B4DJY2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM233B4DJY2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM233B4DJY2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM233B4DJY2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM233B4DJY2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM233B4DJY2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM233B4DJY2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM233B4DJY2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM233B4DJY2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM233B4DJY2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM233B4DJY2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM233B4DJY2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM233B4DJY2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms