Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PALM2-AKAP2B1ALY0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PALM2-AKAP2B1ALY0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PALM2-AKAP2B1ALY0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PALM2-AKAP2B1ALY0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PALM2-AKAP2B1ALY0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALM2-AKAP2B1ALY0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALM2-AKAP2B1ALY0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALM2-AKAP2B1ALY0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALM2-AKAP2B1ALY0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALM2-AKAP2B1ALY0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PALM2-AKAP2B1ALY0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PALM2-AKAP2B1ALY0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PALM2-AKAP2B1ALY0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PALM2-AKAP2B1ALY0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALM2-AKAP2B1ALY0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALM2-AKAP2B1ALY0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALM2-AKAP2B1ALY0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALM2-AKAP2B1ALY0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALM2-AKAP2B1ALY0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALM2-AKAP2B1ALY0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PALM2-AKAP2B1ALY0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PALM2-AKAP2B1ALY0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PALM2-AKAP2B1ALY0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PALM2-AKAP2B1ALY0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PALM2-AKAP2B1ALY0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms