Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTLL13PA6NNM8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TTLL13PA6NNM8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTLL13PA6NNM8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL13PA6NNM8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL13PA6NNM8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL13PA6NNM8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL13PA6NNM8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL13PA6NNM8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL13PA6NNM8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL13PA6NNM8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL13PA6NNM8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL13PA6NNM8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTLL13PA6NNM8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL13PA6NNM8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL13PA6NNM8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL13PA6NNM8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL13PA6NNM8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL13PA6NNM8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL13PA6NNM8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL13PA6NNM8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL13PA6NNM8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL13PA6NNM8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL13PA6NNM8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL13PA6NNM8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTLL13PA6NNM8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTLL13PA6NNM8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTLL13PA6NNM8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL13PA6NNM8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL13PA6NNM8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TTLL13PA6NNM8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL13PA6NNM8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL13PA6NNM8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL13PA6NNM8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL13PA6NNM8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL13PA6NNM8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TTLL13PA6NNM8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTLL13PA6NNM8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TTLL13PA6NNM8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TTLL13PA6NNM8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TTLL13PA6NNM8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTLL13PA6NNM8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTLL13PA6NNM8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTLL13PA6NNM8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TTLL13PA6NNM8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTLL13PA6NNM8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTLL13PA6NNM8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTLL13PA6NNM8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTLL13PA6NNM8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TTLL13PA6NNM8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTLL13PA6NNM8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTLL13PA6NNM8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TTLL13PA6NNM8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TTLL13PA6NNM8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTLL13PA6NNM8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTLL13PA6NNM8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTLL13PA6NNM8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTLL13PA6NNM8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTLL13PA6NNM8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTLL13PA6NNM8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTLL13PA6NNM8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTLL13PA6NNM8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TTLL13PA6NNM8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTLL13PA6NNM8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTLL13PA6NNM8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTLL13PA6NNM8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTLL13PA6NNM8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTLL13PA6NNM8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTLL13PA6NNM8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTLL13PA6NNM8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTLL13PA6NNM8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTLL13PA6NNM8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms