Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRM3A6NNA2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRM3A6NNA2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRM3A6NNA2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRM3A6NNA2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRM3A6NNA2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRM3A6NNA2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRRM3A6NNA2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRRM3A6NNA2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRRM3A6NNA2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRRM3A6NNA2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SRRM3A6NNA2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRRM3A6NNA2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SRRM3A6NNA2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRRM3A6NNA2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRRM3A6NNA2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRRM3A6NNA2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRRM3A6NNA2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRRM3A6NNA2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRRM3A6NNA2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SRRM3A6NNA2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRRM3A6NNA2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRRM3A6NNA2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRRM3A6NNA2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRRM3A6NNA2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRRM3A6NNA2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRRM3A6NNA2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRRM3A6NNA2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRRM3A6NNA2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRRM3A6NNA2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRRM3A6NNA2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRM3A6NNA2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRM3A6NNA2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRM3A6NNA2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRM3A6NNA2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRM3A6NNA2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRM3A6NNA2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRM3A6NNA2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms