Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDR42E2A6NKP2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDR42E2A6NKP2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDR42E2A6NKP2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDR42E2A6NKP2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDR42E2A6NKP2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDR42E2A6NKP2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDR42E2A6NKP2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDR42E2A6NKP2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SDR42E2A6NKP2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDR42E2A6NKP2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDR42E2A6NKP2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDR42E2A6NKP2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDR42E2A6NKP2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDR42E2A6NKP2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDR42E2A6NKP2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDR42E2A6NKP2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDR42E2A6NKP2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDR42E2A6NKP2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDR42E2A6NKP2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDR42E2A6NKP2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDR42E2A6NKP2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDR42E2A6NKP2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDR42E2A6NKP2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDR42E2A6NKP2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDR42E2A6NKP2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDR42E2A6NKP2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDR42E2A6NKP2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDR42E2A6NKP2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDR42E2A6NKP2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDR42E2A6NKP2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDR42E2A6NKP2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDR42E2A6NKP2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDR42E2A6NKP2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDR42E2A6NKP2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDR42E2A6NKP2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDR42E2A6NKP2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDR42E2A6NKP2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SDR42E2A6NKP2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SDR42E2A6NKP2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SDR42E2A6NKP2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDR42E2A6NKP2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDR42E2A6NKP2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDR42E2A6NKP2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDR42E2A6NKP2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDR42E2A6NKP2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDR42E2A6NKP2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDR42E2A6NKP2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDR42E2A6NKP2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDR42E2A6NKP2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDR42E2A6NKP2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDR42E2A6NKP2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDR42E2A6NKP2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SDR42E2A6NKP2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SDR42E2A6NKP2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SDR42E2A6NKP2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SDR42E2A6NKP2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SDR42E2A6NKP2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDR42E2A6NKP2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDR42E2A6NKP2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDR42E2A6NKP2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDR42E2A6NKP2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDR42E2A6NKP2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDR42E2A6NKP2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDR42E2A6NKP2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDR42E2A6NKP2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDR42E2A6NKP2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDR42E2A6NKP2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDR42E2A6NKP2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDR42E2A6NKP2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDR42E2A6NKP2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDR42E2A6NKP2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms