Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCNX2A6NKB5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PCNX2A6NKB5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCNX2A6NKB5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PCNX2A6NKB5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCNX2A6NKB5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCNX2A6NKB5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCNX2A6NKB5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCNX2A6NKB5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCNX2A6NKB5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCNX2A6NKB5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCNX2A6NKB5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCNX2A6NKB5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCNX2A6NKB5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCNX2A6NKB5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCNX2A6NKB5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCNX2A6NKB5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCNX2A6NKB5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCNX2A6NKB5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNX2A6NKB5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNX2A6NKB5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCNX2A6NKB5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCNX2A6NKB5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCNX2A6NKB5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNX2A6NKB5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNX2A6NKB5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNX2A6NKB5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNX2A6NKB5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNX2A6NKB5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNX2A6NKB5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNX2A6NKB5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNX2A6NKB5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNX2A6NKB5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNX2A6NKB5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNX2A6NKB5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNX2A6NKB5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PCNX2A6NKB5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCNX2A6NKB5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms