Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIPT2A6NK58 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LIPT2A6NK58 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIPT2A6NK58 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIPT2A6NK58 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIPT2A6NK58 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIPT2A6NK58 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIPT2A6NK58 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIPT2A6NK58 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LIPT2A6NK58 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIPT2A6NK58 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIPT2A6NK58 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIPT2A6NK58 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIPT2A6NK58 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIPT2A6NK58 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIPT2A6NK58 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIPT2A6NK58 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIPT2A6NK58 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIPT2A6NK58 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIPT2A6NK58 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIPT2A6NK58 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIPT2A6NK58 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIPT2A6NK58 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LIPT2A6NK58 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIPT2A6NK58 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIPT2A6NK58 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LIPT2A6NK58 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPT2A6NK58 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPT2A6NK58 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPT2A6NK58 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIPT2A6NK58 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIPT2A6NK58 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIPT2A6NK58 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIPT2A6NK58 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIPT2A6NK58 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIPT2A6NK58 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIPT2A6NK58 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIPT2A6NK58 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIPT2A6NK58 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIPT2A6NK58 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIPT2A6NK58 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIPT2A6NK58 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIPT2A6NK58 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LIPT2A6NK58 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIPT2A6NK58 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIPT2A6NK58 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIPT2A6NK58 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIPT2A6NK58 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIPT2A6NK58 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LIPT2A6NK58 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIPT2A6NK58 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIPT2A6NK58 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIPT2A6NK58 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIPT2A6NK58 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIPT2A6NK58 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIPT2A6NK58 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIPT2A6NK58 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIPT2A6NK58 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIPT2A6NK58 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIPT2A6NK58 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIPT2A6NK58 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIPT2A6NK58 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIPT2A6NK58 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIPT2A6NK58 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.5 ms