Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCAF2A6NFQ2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCAF2A6NFQ2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCAF2A6NFQ2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCAF2A6NFQ2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCAF2A6NFQ2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCAF2A6NFQ2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCAF2A6NFQ2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCAF2A6NFQ2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCAF2A6NFQ2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCAF2A6NFQ2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCAF2A6NFQ2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCAF2A6NFQ2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCAF2A6NFQ2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TCAF2A6NFQ2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCAF2A6NFQ2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCAF2A6NFQ2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCAF2A6NFQ2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCAF2A6NFQ2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCAF2A6NFQ2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TCAF2A6NFQ2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCAF2A6NFQ2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCAF2A6NFQ2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TCAF2A6NFQ2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCAF2A6NFQ2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCAF2A6NFQ2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCAF2A6NFQ2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCAF2A6NFQ2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCAF2A6NFQ2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCAF2A6NFQ2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCAF2A6NFQ2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCAF2A6NFQ2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TCAF2A6NFQ2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCAF2A6NFQ2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCAF2A6NFQ2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCAF2A6NFQ2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCAF2A6NFQ2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCAF2A6NFQ2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCAF2A6NFQ2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCAF2A6NFQ2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TCAF2A6NFQ2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCAF2A6NFQ2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCAF2A6NFQ2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCAF2A6NFQ2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCAF2A6NFQ2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCAF2A6NFQ2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCAF2A6NFQ2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCAF2A6NFQ2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCAF2A6NFQ2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCAF2A6NFQ2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCAF2A6NFQ2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCAF2A6NFQ2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCAF2A6NFQ2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCAF2A6NFQ2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCAF2A6NFQ2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCAF2A6NFQ2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCAF2A6NFQ2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCAF2A6NFQ2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TCAF2A6NFQ2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms