Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN8

Putative ubiquitin-like protein FUBI-like protein ENSP00000310146, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NDN8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A6NDN8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A6NDN8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A6NDN8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A6NDN8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A6NDN8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A6NDN8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A6NDN8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A6NDN8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A6NDN8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A6NDN8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A6NDN8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A6NDN8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A6NDN8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A6NDN8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A6NDN8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A6NDN8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A6NDN8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A6NDN8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
A6NDN8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
A6NDN8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
A6NDN8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
A6NDN8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A6NDN8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A6NDN8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A6NDN8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A6NDN8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A6NDN8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A6NDN8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A6NDN8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A6NDN8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A6NDN8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A6NDN8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A6NDN8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A6NDN8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A6NDN8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A6NDN8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A6NDN8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A6NDN8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A6NDN8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A6NDN8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A6NDN8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A6NDN8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A6NDN8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A6NDN8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A6NDN8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A6NDN8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
A6NDN8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A6NDN8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
A6NDN8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A6NDN8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
A6NDN8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A6NDN8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A6NDN8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A6NDN8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A6NDN8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A6NDN8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A6NDN8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A6NDN8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A6NDN8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
A6NDN8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
A6NDN8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
A6NDN8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A6NDN8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A6NDN8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A6NDN8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A6NDN8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A6NDN8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A6NDN8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A6NDN8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
A6NDN8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A6NDN8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A6NDN8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A6NDN8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A6NDN8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A6NDN8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A6NDN8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
A6NDN8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A6NDN8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A6NDN8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A6NDN8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A6NDN8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A6NDN8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A6NDN8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A6NDN8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A6NDN8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
A6NDN8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A6NDN8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
A6NDN8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A6NDN8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A6NDN8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NDN8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NDN8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NDN8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NDN8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NDN8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NDN8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NDN8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NDN8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NDN8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms