Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GMNCA6NCL1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GMNCA6NCL1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GMNCA6NCL1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GMNCA6NCL1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GMNCA6NCL1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GMNCA6NCL1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GMNCA6NCL1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GMNCA6NCL1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GMNCA6NCL1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GMNCA6NCL1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GMNCA6NCL1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GMNCA6NCL1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GMNCA6NCL1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GMNCA6NCL1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GMNCA6NCL1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GMNCA6NCL1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GMNCA6NCL1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GMNCA6NCL1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GMNCA6NCL1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GMNCA6NCL1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GMNCA6NCL1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GMNCA6NCL1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GMNCA6NCL1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GMNCA6NCL1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GMNCA6NCL1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GMNCA6NCL1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GMNCA6NCL1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GMNCA6NCL1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GMNCA6NCL1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GMNCA6NCL1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GMNCA6NCL1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GMNCA6NCL1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GMNCA6NCL1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GMNCA6NCL1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GMNCA6NCL1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GMNCA6NCL1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GMNCA6NCL1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GMNCA6NCL1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GMNCA6NCL1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GMNCA6NCL1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GMNCA6NCL1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GMNCA6NCL1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GMNCA6NCL1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GMNCA6NCL1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GMNCA6NCL1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GMNCA6NCL1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GMNCA6NCL1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GMNCA6NCL1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GMNCA6NCL1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GMNCA6NCL1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GMNCA6NCL1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GMNCA6NCL1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GMNCA6NCL1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GMNCA6NCL1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GMNCA6NCL1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GMNCA6NCL1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GMNCA6NCL1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
GMNCA6NCL1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GMNCA6NCL1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GMNCA6NCL1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GMNCA6NCL1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GMNCA6NCL1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GMNCA6NCL1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GMNCA6NCL1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GMNCA6NCL1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GMNCA6NCL1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GMNCA6NCL1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GMNCA6NCL1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GMNCA6NCL1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GMNCA6NCL1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GMNCA6NCL1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms