Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBA6A0AVT1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBA6A0AVT1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBA6A0AVT1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBA6A0AVT1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
UBA6A0AVT1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
UBA6A0AVT1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
UBA6A0AVT1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
UBA6A0AVT1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBA6A0AVT1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBA6A0AVT1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBA6A0AVT1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBA6A0AVT1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBA6A0AVT1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBA6A0AVT1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBA6A0AVT1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBA6A0AVT1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBA6A0AVT1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBA6A0AVT1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBA6A0AVT1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBA6A0AVT1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBA6A0AVT1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBA6A0AVT1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UBA6A0AVT1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBA6A0AVT1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBA6A0AVT1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBA6A0AVT1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBA6A0AVT1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBA6A0AVT1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBA6A0AVT1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBA6A0AVT1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBA6A0AVT1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
UBA6A0AVT1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBA6A0AVT1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBA6A0AVT1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
UBA6A0AVT1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBA6A0AVT1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBA6A0AVT1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBA6A0AVT1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBA6A0AVT1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms