Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S3A2A0A539 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCRBV7S3A2A0A539 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCRBV7S3A2A0A539 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCRBV7S3A2A0A539 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCRBV7S3A2A0A539 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCRBV7S3A2A0A539 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCRBV7S3A2A0A539 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCRBV7S3A2A0A539 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCRBV7S3A2A0A539 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCRBV7S3A2A0A539 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCRBV7S3A2A0A539 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCRBV7S3A2A0A539 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCRBV7S3A2A0A539 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TCRBV7S3A2A0A539 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCRBV7S3A2A0A539 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCRBV7S3A2A0A539 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCRBV7S3A2A0A539 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCRBV7S3A2A0A539 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCRBV7S3A2A0A539 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCRBV7S3A2A0A539 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCRBV7S3A2A0A539 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCRBV7S3A2A0A539 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCRBV7S3A2A0A539 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCRBV7S3A2A0A539 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCRBV7S3A2A0A539 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCRBV7S3A2A0A539 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCRBV7S3A2A0A539 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCRBV7S3A2A0A539 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCRBV7S3A2A0A539 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCRBV7S3A2A0A539 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCRBV7S3A2A0A539 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCRBV7S3A2A0A539 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCRBV7S3A2A0A539 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCRBV7S3A2A0A539 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TCRBV7S3A2A0A539 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCRBV7S3A2A0A539 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCRBV7S3A2A0A539 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCRBV7S3A2A0A539 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCRBV7S3A2A0A539 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCRBV7S3A2A0A539 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCRBV7S3A2A0A539 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCRBV7S3A2A0A539 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCRBV7S3A2A0A539 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCRBV7S3A2A0A539 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCRBV7S3A2A0A539 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCRBV7S3A2A0A539 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCRBV7S3A2A0A539 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCRBV7S3A2A0A539 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCRBV7S3A2A0A539 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TCRBV7S3A2A0A539 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCRBV7S3A2A0A539 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCRBV7S3A2A0A539 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCRBV7S3A2A0A539 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCRBV7S3A2A0A539 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCRBV7S3A2A0A539 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCRBV7S3A2A0A539 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
TCRBV7S3A2A0A539 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCRBV7S3A2A0A539 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCRBV7S3A2A0A539 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCRBV7S3A2A0A539 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCRBV7S3A2A0A539 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TCRBV7S3A2A0A539 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCRBV7S3A2A0A539 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TCRBV7S3A2A0A539 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCRBV7S3A2A0A539 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCRBV7S3A2A0A539 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCRBV7S3A2A0A539 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCRBV7S3A2A0A539 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCRBV7S3A2A0A539 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCRBV7S3A2A0A539 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TCRBV7S3A2A0A539 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCRBV7S3A2A0A539 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCRBV7S3A2A0A539 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCRBV7S3A2A0A539 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCRBV7S3A2A0A539 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCRBV7S3A2A0A539 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCRBV7S3A2A0A539 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCRBV7S3A2A0A539 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCRBV7S3A2A0A539 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TCRBV7S3A2A0A539 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TCRBV7S3A2A0A539 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCRBV7S3A2A0A539 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCRBV7S3A2A0A539 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCRBV7S3A2A0A539 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCRBV7S3A2A0A539 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCRBV7S3A2A0A539 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCRBV7S3A2A0A539 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCRBV7S3A2A0A539 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCRBV7S3A2A0A539 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCRBV7S3A2A0A539 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCRBV7S3A2A0A539 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCRBV7S3A2A0A539 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCRBV7S3A2A0A539 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCRBV7S3A2A0A539 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCRBV7S3A2A0A539 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCRBV7S3A2A0A539 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
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