RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439600.2

LMO3-207, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2

Gene LMO3, Length 1,044 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-207ENST00000439600 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.14■■■□□ 2.58
LMO3-207ENST00000439600 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
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LMO3-207ENST00000439600 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
LMO3-207ENST00000439600 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.62■■□□□ 1.69
LMO3-207ENST00000439600 NISCHQ9Y2I1 1504 aa25.16■■□□□ 1.62
LMO3-207ENST00000439600 FOXD1Q16676 465 aa24.37■■□□□ 1.49
LMO3-207ENST00000439600 ADRA2BP18089 450 aa23.92■■□□□ 1.42
LMO3-207ENST00000439600 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.9■■□□□ 1.42
LMO3-207ENST00000439600 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
LMO3-207ENST00000439600 KCNA4P22459 653 aa22.74■■□□□ 1.23
LMO3-207ENST00000439600 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.6■■□□□ 1.21
LMO3-207ENST00000439600 MSH5O43196 834 aa22.34■■□□□ 1.17
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LMO3-207ENST00000439600 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO3-207ENST00000439600 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
LMO3-207ENST00000439600 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.88■■□□□ 1.09
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LMO3-207ENST00000439600 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
LMO3-207ENST00000439600 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.36■■□□□ 1.01
LMO3-207ENST00000439600 ABCC9O60706 1549 aa21.32■■□□□ 1
LMO3-207ENST00000439600 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.31■■□□□ 1
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LMO3-207ENST00000439600 ERCC6Q03468 1493 aa18.42■□□□□ 0.54
LMO3-207ENST00000439600 DSG3P32926 999 aa18.42■□□□□ 0.54
LMO3-207ENST00000439600 CEP164Q9UPV0 1460 aa18.38■□□□□ 0.53
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LMO3-207ENST00000439600 PRDM2Q13029 1718 aa18.27■□□□□ 0.52
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