RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000088652.5

Htatsf1-201, Transcript of HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Htatsf1, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 NischQ80TM9 1593 aa30.77■■■□□ 2.52
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Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Rhox8Q6VSS7 320 aa28.28■■■□□ 2.12
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Rtl1Q7M732 1744 aa28.27■■■□□ 2.12
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Ccdc180J3QNE4 1664 aa27.67■■■□□ 2.02
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Dcaf1Q80TR8 1506 aa27.44■■□□□ 1.98
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 ScribQ80U72 1612 aa27.22■■□□□ 1.95
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Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Baz1aO88379 1555 aa26.7■■□□□ 1.86
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa26.64■■□□□ 1.86
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 NacadQ5SWP3 1504 aa26.58■■□□□ 1.85
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 HrcG5E8J6 738 aa26.33■■□□□ 1.8
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Crybg2B7ZCC2 1516 aa26.32■■□□□ 1.8
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa26.2■■□□□ 1.78
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Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Sycp2Q9CUU3 1500 aa25.98■■□□□ 1.75
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Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Pcgf6Q99NA9 353 aa25.5■■□□□ 1.67
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Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa25.33■■□□□ 1.65
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Synj1Q8CHC4 1574 aa25.18■■□□□ 1.62
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Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Cngb1E1AZ71 1325 aa25.09■■□□□ 1.61
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Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa24.96■■□□□ 1.59
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Top2bQ64511 1612 aa24.92■■□□□ 1.58
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Gab3Q8BSM5 595 aa24.71■■□□□ 1.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa24.58■■□□□ 1.53
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Neurod1Q60867 357 aa24.55■■□□□ 1.52
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Fmn1Q05860 1466 aa24.55■■□□□ 1.52
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa24.5■■□□□ 1.51
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Zeb1Q64318 1117 aa24.48■■□□□ 1.51
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa24.41■■□□□ 1.5
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Mier1Q5UAK0 511 aa24.27■■□□□ 1.48
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 NefmP08553 848 aa24.23■■□□□ 1.47
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Sall2Q9QX96 1004 aa24.17■■□□□ 1.46
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Cep162Q6ZQ06 1403 aa24.17■■□□□ 1.46
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 TnnQ80Z71 1560 aa24.16■■□□□ 1.46
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Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Wdr62Q3U3T8 1523 aa24.03■■□□□ 1.44
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Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Lamc3Q9R0B6 1581 aa23.93■■□□□ 1.42
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Npm2Q80W85 207 aa23.9■■□□□ 1.42
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Myt1lP97500 1187 aa23.86■■□□□ 1.41
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Ercc6F8VPZ5 1481 aa23.83■■□□□ 1.41
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Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Anks4bQ8K3X6 423 aa23.8■■□□□ 1.4
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa23.77■■□□□ 1.4
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Csrnp3P59055 597 aa23.77■■□□□ 1.4
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Clip1Q922J3 1391 aa23.77■■□□□ 1.4
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Arhgap35Q91YM2 1499 aa23.77■■□□□ 1.4
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Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Unc13aQ4KUS2 1712 aa23.73■■□□□ 1.39
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Kif15Q6P9L6 1387 aa23.72■■□□□ 1.39
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Camsap1A2AHC3 1581 aa23.7■■□□□ 1.39
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 PtprkP35822 1457 aa23.69■■□□□ 1.38
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Shroom4Q1W617 1475 aa23.68■■□□□ 1.38
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Map3k1P53349 1493 aa23.66■■□□□ 1.38
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Eea1Q8BL66 1411 aa23.6■■□□□ 1.37
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Ccdc18Q640L5 1455 aa23.59■■□□□ 1.37
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa23.58■■□□□ 1.37
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Grin2bQ01097 1482 aa23.55■■□□□ 1.36
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa23.53■■□□□ 1.36
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Htatsf1-201ENSMUST00000088652 ClspnQ80YR7 1315 aa23.5■■□□□ 1.35
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Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Il27Q8K3I6 234 aa23.49■■□□□ 1.35
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa23.49■■□□□ 1.35
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa23.45■■□□□ 1.34
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Setd5Q5XJV7 1441 aa23.43■■□□□ 1.34
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Erich3F6QRE9 1637 aa23.38■■□□□ 1.33
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Tiam1Q60610 1591 aa23.35■■□□□ 1.33
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Baz1bQ9Z277 1479 aa23.33■■□□□ 1.33
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Cux2P70298 1426 aa23.32■■□□□ 1.32
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 TonslQ6NZL6 1363 aa23.31■■□□□ 1.32
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