RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000064433.10

Tmod2-201, Transcript of Tropomodulin-2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Tmod2, Length 9,884 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Rhox8Q6VSS7 320 aa19.12■□□□□ 0.65
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Cngb1E1AZ71 1325 aa18.05■□□□□ 0.48
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa17.98■□□□□ 0.47
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Wdr66E9Q743 1299 aa17.47■□□□□ 0.39
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Amer1Q7TS75 1132 aa17.39■□□□□ 0.37
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Ube2uB1AUC4 352 aa17.3■□□□□ 0.36
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Zeb1Q64318 1117 aa17.13■□□□□ 0.33
Tmod2-201ENSMUST00000064433 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa16.9■□□□□ 0.3
Tmod2-201ENSMUST00000064433 CenpbP27790 599 aa16.88■□□□□ 0.29
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa16.7■□□□□ 0.26
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Npm2Q80W85 207 aa16.69■□□□□ 0.26
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Gab3Q8BSM5 595 aa16.65■□□□□ 0.26
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa16.64■□□□□ 0.25
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Stra8P70278 393 aa16.62■□□□□ 0.25
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Slc24a1Q91WD8 1130 aa16.56■□□□□ 0.24
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Myt1lP97500 1187 aa16.53■□□□□ 0.24
Tmod2-201ENSMUST00000064433 4933416C03RikQ3V063 378 aa16.45■□□□□ 0.22
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Trim41Q5NCC3 630 aa16.3■□□□□ 0.2
Tmod2-201ENSMUST00000064433 NefmP08553 848 aa16.26■□□□□ 0.19
Tmod2-201ENSMUST00000064433 UbtfP25976 765 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
Tmod2-201ENSMUST00000064433 NeflP08551 543 aa16.19■□□□□ 0.18
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Myt1Q8CFC2 1127 aa16.16■□□□□ 0.18
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
Tmod2-201ENSMUST00000064433 NrdcQ8BHG1 1161 aa16.09■□□□□ 0.17
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Tnnt3Q9QZ47 272 aa15.99■□□□□ 0.15
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Os9Q8K2C7 672 aa15.89■□□□□ 0.13
Tmod2-201ENSMUST00000064433 HrcG5E8J6 738 aa15.89■□□□□ 0.13
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Neurod1Q60867 357 aa15.88■□□□□ 0.13
Tmod2-201ENSMUST00000064433 NclP09405 707 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.13
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Ccdc180J3QNE4 1664 aa15.79■□□□□ 0.12
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Rtl5Q5DTT4 599 aa15.79■□□□□ 0.12
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Rtl1Q7M732 1744 aa15.78■□□□□ 0.12
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Pcgf6Q99NA9 353 aa15.66■□□□□ 0.1
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Il27Q8K3I6 234 aa15.63■□□□□ 0.09
Tmod2-201ENSMUST00000064433 DaxxO35613 739 aa15.62■□□□□ 0.09
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa15.6■□□□□ 0.09
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa15.59■□□□□ 0.09
Tmod2-201ENSMUST00000064433 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
Tmod2-201ENSMUST00000064433 CatipB9EKE5 520 aa15.53■□□□□ 0.08
Tmod2-201ENSMUST00000064433 TonslQ6NZL6 1363 aa15.48■□□□□ 0.07
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Anp32aO35381 247 aa15.38■□□□□ 0.05
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Chic1Q8CBW7 227 aa15.38■□□□□ 0.05
Tmod2-201ENSMUST00000064433 NischQ80TM9 1593 aa15.37■□□□□ 0.05
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
Tmod2-201ENSMUST00000064433 ArxO35085 564 aa15.34■□□□□ 0.05
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Nlrp6Q91WS2 869 aa15.31■□□□□ 0.04
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Gm13697A2AK42 830 aa15.31■□□□□ 0.04
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa15.3■□□□□ 0.04
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Polr3glQ8R0C0 218 aa15.3■□□□□ 0.04
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Lmod3E9QA62 571 aa15.22■□□□□ 0.03
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Zbtb4Q5F293 982 aa15.17■□□□□ 0.02
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Atp1b4Q99ME6 356 aa15.17■□□□□ 0.02
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa15.14■□□□□ 0.01
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Erich6D3Z6S9 713 aa15.12■□□□□ 0.01
Tmod2-201ENSMUST00000064433 ClspnQ80YR7 1315 aa15.11■□□□□ 0.01
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Mier1Q5UAK0 511 aa15.08■□□□□ 0
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Gm13695A2AK44 830 aa15.06■□□□□ 0
Tmod2-201ENSMUST00000064433 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Csrnp3P59055 597 aa15.01□□□□□ -0.01
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Gm38655A0A286YDK6 273 aa14.99□□□□□ -0.01
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Lmod2Q3UHZ5 550 aa14.98□□□□□ -0.01
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa14.96□□□□□ -0.01
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa14.95□□□□□ -0.02
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Vsig10D3YX43 558 aa14.95□□□□□ -0.02
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa14.9□□□□□ -0.02
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Trim44Q9QXA7 346 aa14.9□□□□□ -0.02
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa14.9□□□□□ -0.02
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa14.88□□□□□ -0.03
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Calr4Q3TQS0 420 aa14.83□□□□□ -0.04
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Znf326O88291 580 aa14.8□□□□□ -0.04
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Fgd1P52734 960 aa14.77□□□□□ -0.05
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Plppr3Q7TPB0 716 aa14.75□□□□□ -0.05
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Tmod2-201ENSMUST00000064433 PtmaP26350 111 aa14.74□□□□□ -0.05
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Anks4bQ8K3X6 423 aa14.72□□□□□ -0.05
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Aplp2Q06335 707 aa14.71□□□□□ -0.05
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Eid3Q3V124 375 aa14.71□□□□□ -0.05
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa14.71□□□□□ -0.06
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Tmod2-201ENSMUST00000064433 CanxP35564 591 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Trim30dE9PWL0 497 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 8 ms