RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049241.8

Hoxb4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxb4, Length 2,566 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 NischQ80TM9 1593 aa33.35■■■□□ 2.93
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa32.71■■■□□ 2.83
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Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Rtl1Q7M732 1744 aa30.72■■■□□ 2.51
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ccdc180J3QNE4 1664 aa30.19■■■□□ 2.42
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Hoxb4-201ENSMUST00000049241 ScribQ80U72 1612 aa29.47■■■□□ 2.31
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa29.26■■■□□ 2.27
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Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Baz1aO88379 1555 aa28.89■■■□□ 2.22
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 HrcG5E8J6 738 aa28.71■■■□□ 2.19
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa28.68■■■□□ 2.18
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 NacadQ5SWP3 1504 aa28.61■■■□□ 2.17
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Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Crybg2B7ZCC2 1516 aa28.25■■■□□ 2.11
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Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Sycp2Q9CUU3 1500 aa28■■■□□ 2.07
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Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa27.58■■■□□ 2.01
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Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Synj1Q8CHC4 1574 aa27.39■■□□□ 1.98
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Golga3P55937 1487 aa27.35■■□□□ 1.97
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa27.34■■□□□ 1.97
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Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Pcgf6Q99NA9 353 aa27.23■■□□□ 1.95
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 CftrP26361 1476 aa27.17■■□□□ 1.94
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Top2bQ64511 1612 aa27.06■■□□□ 1.92
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Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa26.84■■□□□ 1.89
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Mier1Q5UAK0 511 aa26.7■■□□□ 1.86
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 NefmP08553 848 aa26.58■■□□□ 1.85
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Fmn1Q05860 1466 aa26.58■■□□□ 1.85
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa26.58■■□□□ 1.85
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Zeb1Q64318 1117 aa26.53■■□□□ 1.84
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa26.47■■□□□ 1.83
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Cep162Q6ZQ06 1403 aa26.36■■□□□ 1.81
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Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Sall2Q9QX96 1004 aa26.16■■□□□ 1.78
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Hoxb4-201ENSMUST00000049241 TnnQ80Z71 1560 aa26.12■■□□□ 1.77
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Neurod1Q60867 357 aa26.11■■□□□ 1.77
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Clip1Q922J3 1391 aa25.99■■□□□ 1.75
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Frmpd1A2AKB4 1549 aa25.93■■□□□ 1.74
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa25.91■■□□□ 1.74
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Wdr62Q3U3T8 1523 aa25.9■■□□□ 1.74
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Arhgap35Q91YM2 1499 aa25.89■■□□□ 1.74
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 PtprkP35822 1457 aa25.88■■□□□ 1.73
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Lamc3Q9R0B6 1581 aa25.83■■□□□ 1.73
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 NrkQ9R0G8 1455 aa25.81■■□□□ 1.72
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Wdr66E9Q743 1299 aa25.8■■□□□ 1.72
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa25.78■■□□□ 1.72
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Arap1Q4LDD4 1452 aa25.72■■□□□ 1.71
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Unc13aQ4KUS2 1712 aa25.72■■□□□ 1.71
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Kif15Q6P9L6 1387 aa25.71■■□□□ 1.71
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Il27Q8K3I6 234 aa25.7■■□□□ 1.71
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Shroom4Q1W617 1475 aa25.68■■□□□ 1.7
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Camsap1A2AHC3 1581 aa25.67■■□□□ 1.7
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Eea1Q8BL66 1411 aa25.67■■□□□ 1.7
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 TonslQ6NZL6 1363 aa25.67■■□□□ 1.7
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 ClspnQ80YR7 1315 aa25.66■■□□□ 1.7
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ercc6F8VPZ5 1481 aa25.62■■□□□ 1.69
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa25.6■■□□□ 1.69
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Map3k1P53349 1493 aa25.59■■□□□ 1.69
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa25.56■■□□□ 1.68
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Setd5Q5XJV7 1441 aa25.56■■□□□ 1.68
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa25.55■■□□□ 1.68
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Grin2bQ01097 1482 aa25.51■■□□□ 1.67
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Anks4bQ8K3X6 423 aa25.5■■□□□ 1.67
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ccdc18Q640L5 1455 aa25.49■■□□□ 1.67
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Kdm5bQ80Y84 1544 aa25.47■■□□□ 1.67
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa25.44■■□□□ 1.66
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Tiam1Q60610 1591 aa25.44■■□□□ 1.66
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Erich3F6QRE9 1637 aa25.4■■□□□ 1.66
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Baz1bQ9Z277 1479 aa25.39■■□□□ 1.65
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ankrd26Q811D2 1581 aa25.39■■□□□ 1.65
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
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Hoxb4-201ENSMUST00000049241 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Eid3Q3V124 375 aa25.32■■□□□ 1.64
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