RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000035812.13

Ttl-201, Transcript of Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttl, Length 4,567 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttl-201ENSMUST00000035812 Rhox8Q6VSS7 320 aa30.28■■■□□ 2.44
Ttl-201ENSMUST00000035812 NischQ80TM9 1593 aa28.66■■■□□ 2.18
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa27.39■■□□□ 1.98
Ttl-201ENSMUST00000035812 Abcc9P70170 1546 aa27.24■■□□□ 1.95
Ttl-201ENSMUST00000035812 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
Ttl-201ENSMUST00000035812 Cngb1E1AZ71 1325 aa26.77■■□□□ 1.88
Ttl-201ENSMUST00000035812 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa26.69■■□□□ 1.86
Ttl-201ENSMUST00000035812 Abcc8B2RUS7 1588 aa26.64■■□□□ 1.85
Ttl-201ENSMUST00000035812 Trim41Q5NCC3 630 aa26.62■■□□□ 1.85
Ttl-201ENSMUST00000035812 Gab3Q8BSM5 595 aa26.21■■□□□ 1.79
Ttl-201ENSMUST00000035812 Zeb1Q64318 1117 aa26.13■■□□□ 1.77
Ttl-201ENSMUST00000035812 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
Ttl-201ENSMUST00000035812 Npm2Q80W85 207 aa25.98■■□□□ 1.75
Ttl-201ENSMUST00000035812 Il27Q8K3I6 234 aa25.81■■□□□ 1.72
Ttl-201ENSMUST00000035812 Myt1lP97500 1187 aa25.78■■□□□ 1.72
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ube2uB1AUC4 352 aa25.26■■□□□ 1.63
Ttl-201ENSMUST00000035812 NacadQ5SWP3 1504 aa25.2■■□□□ 1.62
Ttl-201ENSMUST00000035812 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa25.1■■□□□ 1.61
Ttl-201ENSMUST00000035812 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
Ttl-201ENSMUST00000035812 HrcG5E8J6 738 aa25.02■■□□□ 1.6
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ccdc180J3QNE4 1664 aa24.92■■□□□ 1.58
Ttl-201ENSMUST00000035812 UbtfP25976 765 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
Ttl-201ENSMUST00000035812 Kdm5dQ62240 1548 aa24.8■■□□□ 1.56
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ubl4bQ9CQ84 188 aa24.79■■□□□ 1.56
Ttl-201ENSMUST00000035812 Rtl1Q7M732 1744 aa24.77■■□□□ 1.56
Ttl-201ENSMUST00000035812 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa24.74■■□□□ 1.55
Ttl-201ENSMUST00000035812 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa24.67■■□□□ 1.54
Ttl-201ENSMUST00000035812 Baz1aO88379 1555 aa24.54■■□□□ 1.52
Ttl-201ENSMUST00000035812 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
Ttl-201ENSMUST00000035812 Wdr66E9Q743 1299 aa24.49■■□□□ 1.51
Ttl-201ENSMUST00000035812 Dcaf1Q80TR8 1506 aa24.43■■□□□ 1.5
Ttl-201ENSMUST00000035812 Chic1Q8CBW7 227 aa24.37■■□□□ 1.49
Ttl-201ENSMUST00000035812 ScribQ80U72 1612 aa24.29■■□□□ 1.48
Ttl-201ENSMUST00000035812 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa24.28■■□□□ 1.48
Ttl-201ENSMUST00000035812 Lmod2Q3UHZ5 550 aa24.22■■□□□ 1.47
Ttl-201ENSMUST00000035812 Sycp2Q9CUU3 1500 aa24.21■■□□□ 1.47
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ercc6F8VPZ5 1481 aa24.19■■□□□ 1.46
Ttl-201ENSMUST00000035812 Kif15Q6P9L6 1387 aa24.12■■□□□ 1.45
Ttl-201ENSMUST00000035812 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
Ttl-201ENSMUST00000035812 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
Ttl-201ENSMUST00000035812 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
Ttl-201ENSMUST00000035812 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa24.04■■□□□ 1.44
Ttl-201ENSMUST00000035812 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
Ttl-201ENSMUST00000035812 NefmP08553 848 aa23.92■■□□□ 1.42
Ttl-201ENSMUST00000035812 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa23.91■■□□□ 1.42
Ttl-201ENSMUST00000035812 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
Ttl-201ENSMUST00000035812 Golga3P55937 1487 aa23.86■■□□□ 1.41
Ttl-201ENSMUST00000035812 Cep164Q5DU05 1446 aa23.82■■□□□ 1.4
Ttl-201ENSMUST00000035812 Neurod1Q60867 357 aa23.82■■□□□ 1.4
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa23.73■■□□□ 1.39
Ttl-201ENSMUST00000035812 Clip1Q922J3 1391 aa23.73■■□□□ 1.39
Ttl-201ENSMUST00000035812 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa23.71■■□□□ 1.39
Ttl-201ENSMUST00000035812 Plppr3Q7TPB0 716 aa23.71■■□□□ 1.39
Ttl-201ENSMUST00000035812 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
Ttl-201ENSMUST00000035812 NclP09405 707 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ccdc18Q640L5 1455 aa23.67■■□□□ 1.38
Ttl-201ENSMUST00000035812 Crybg2B7ZCC2 1516 aa23.66■■□□□ 1.38
Ttl-201ENSMUST00000035812 Slc24a1Q91WD8 1130 aa23.63■■□□□ 1.37
Ttl-201ENSMUST00000035812 Os9Q8K2C7 672 aa23.62■■□□□ 1.37
Ttl-201ENSMUST00000035812 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
Ttl-201ENSMUST00000035812 Mier1Q5UAK0 511 aa23.54■■□□□ 1.36
Ttl-201ENSMUST00000035812 Gm13697A2AK42 830 aa23.51■■□□□ 1.35
Ttl-201ENSMUST00000035812 CftrP26361 1476 aa23.5■■□□□ 1.35
Ttl-201ENSMUST00000035812 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
Ttl-201ENSMUST00000035812 Arhgap27A2AB59 869 aa23.44■■□□□ 1.34
Ttl-201ENSMUST00000035812 Setd5Q5XJV7 1441 aa23.4■■□□□ 1.34
Ttl-201ENSMUST00000035812 Cux2P70298 1426 aa23.39■■□□□ 1.34
Ttl-201ENSMUST00000035812 Smarca2Q6DIC0 1577 aa23.37■■□□□ 1.33
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa23.35■■□□□ 1.33
Ttl-201ENSMUST00000035812 Erich6D3Z6S9 713 aa23.35■■□□□ 1.33
Ttl-201ENSMUST00000035812 BlmO88700 1416 aa23.34■■□□□ 1.33
Ttl-201ENSMUST00000035812 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
Ttl-201ENSMUST00000035812 Chic2Q9D9G3 165 aa23.3■■□□□ 1.32
Ttl-201ENSMUST00000035812 Eid3Q3V124 375 aa23.3■■□□□ 1.32
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa23.3■■□□□ 1.32
Ttl-201ENSMUST00000035812 TonslQ6NZL6 1363 aa23.26■■□□□ 1.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Synj1Q8CHC4 1574 aa23.24■■□□□ 1.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Fmn1Q05860 1466 aa23.19■■□□□ 1.3
Ttl-201ENSMUST00000035812 Zbtb4Q5F293 982 aa23.16■■□□□ 1.3
Ttl-201ENSMUST00000035812 Atp1b4Q99ME6 356 aa23.16■■□□□ 1.3
Ttl-201ENSMUST00000035812 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa23.12■■□□□ 1.29
Ttl-201ENSMUST00000035812 Gm13695A2AK44 830 aa23.06■■□□□ 1.28
Ttl-201ENSMUST00000035812 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
Ttl-201ENSMUST00000035812 Eea1Q8BL66 1411 aa23.06■■□□□ 1.28
Ttl-201ENSMUST00000035812 AknaQ80VW7 1404 aa23.02■■□□□ 1.28
Ttl-201ENSMUST00000035812 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
Ttl-201ENSMUST00000035812 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
Ttl-201ENSMUST00000035812 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
Ttl-201ENSMUST00000035812 Arid3cA6PWV5 409 aa22.94■■□□□ 1.26
Ttl-201ENSMUST00000035812 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Ttl-201ENSMUST00000035812 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa22.94■■□□□ 1.26
Ttl-201ENSMUST00000035812 BicraF8VPZ9 1578 aa22.92■■□□□ 1.26
Ttl-201ENSMUST00000035812 NrdcQ8BHG1 1161 aa22.91■■□□□ 1.26
Ttl-201ENSMUST00000035812 Stra8P70278 393 aa22.89■■□□□ 1.26
Ttl-201ENSMUST00000035812 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa22.88■■□□□ 1.25
Ttl-201ENSMUST00000035812 Baz1bQ9Z277 1479 aa22.88■■□□□ 1.25
Ttl-201ENSMUST00000035812 Cep162Q6ZQ06 1403 aa22.87■■□□□ 1.25
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