RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028410.3

Xirp2-201, Transcript of Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Xirp2, Length 11,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2-201ENSMUST00000028410 Rhox8Q6VSS7 320 aa8,49□□□□□ -1,05
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Xirp2-201ENSMUST00000028410 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP7,58□□□□□ -1,2
Xirp2-201ENSMUST00000028410 Ube2uB1AUC4 352 aa7,58□□□□□ -1,2
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Xirp2-201ENSMUST00000028410 Zeb1Q64318 1117 aa7,53□□□□□ -1,2
Xirp2-201ENSMUST00000028410 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP7,48□□□□□ -1,21
Xirp2-201ENSMUST00000028410 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa7,47□□□□□ -1,21
Xirp2-201ENSMUST00000028410 Wdr66E9Q743 1299 aa7,47□□□□□ -1,21
Xirp2-201ENSMUST00000028410 Npm2Q80W85 207 aa7,44□□□□□ -1,22
Xirp2-201ENSMUST00000028410 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP7,41□□□□□ -1,22
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Xirp2-201ENSMUST00000028410 Myt1lP97500 1187 aa7,34□□□□□ -1,23
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Xirp2-201ENSMUST00000028410 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa6,89□□□□□ -1,31
Xirp2-201ENSMUST00000028410 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa6,88□□□□□ -1,31
Xirp2-201ENSMUST00000028410 Gm13697A2AK42 830 aa6,88□□□□□ -1,31
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Xirp2-201ENSMUST00000028410 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP6,86□□□□□ -1,31
Xirp2-201ENSMUST00000028410 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa6,84□□□□□ -1,31
Xirp2-201ENSMUST00000028410 4933416C03RikQ3V063 378 aa6,83□□□□□ -1,32
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Xirp2-201ENSMUST00000028410 Chic1Q8CBW7 227 aa6,81□□□□□ -1,32
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Xirp2-201ENSMUST00000028410 Gm13695A2AK44 830 aa6,75□□□□□ -1,33
Xirp2-201ENSMUST00000028410 Tnnt3Q9QZ47 272 aa6,75□□□□□ -1,33
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Xirp2-201ENSMUST00000028410 Nlrp6Q91WS2 869 aa6,7□□□□□ -1,34
Xirp2-201ENSMUST00000028410 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP6,69□□□□□ -1,34
Xirp2-201ENSMUST00000028410 Zbtb4Q5F293 982 aa6,68□□□□□ -1,34
Xirp2-201ENSMUST00000028410 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa6,66□□□□□ -1,34
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Xirp2-201ENSMUST00000028410 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP6,63□□□□□ -1,35
Xirp2-201ENSMUST00000028410 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa6,62□□□□□ -1,35
Xirp2-201ENSMUST00000028410 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP6,59□□□□□ -1,35
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Xirp2-201ENSMUST00000028410 Pcgf6Q99NA9 353 aa6,57□□□□□ -1,36
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Xirp2-201ENSMUST00000028410 ArxO35085 564 aa6,53□□□□□ -1,36
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Xirp2-201ENSMUST00000028410 DaxxO35613 739 aa6,5□□□□□ -1,37
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Xirp2-201ENSMUST00000028410 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa6,49□□□□□ -1,37
Xirp2-201ENSMUST00000028410 Clip1Q922J3 1391 aa6,48□□□□□ -1,37
Xirp2-201ENSMUST00000028410 ClspnQ80YR7 1315 aa6,48□□□□□ -1,37
Xirp2-201ENSMUST00000028410 Abcc8B2RUS7 1588 aa6,45□□□□□ -1,38
Xirp2-201ENSMUST00000028410 Anp32aO35381 247 aa6,45□□□□□ -1,38
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Xirp2-201ENSMUST00000028410 Znf326O88291 580 aa6,42□□□□□ -1,38
Xirp2-201ENSMUST00000028410 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP6,41□□□□□ -1,38
Xirp2-201ENSMUST00000028410 Chic2Q9D9G3 165 aa6,41□□□□□ -1,38
Xirp2-201ENSMUST00000028410 Clstn2Q9ER65 966 aa6,41□□□□□ -1,38
Xirp2-201ENSMUST00000028410 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP6,41□□□□□ -1,38
Xirp2-201ENSMUST00000028410 Ercc6F8VPZ5 1481 aa6,4□□□□□ -1,38
Xirp2-201ENSMUST00000028410 Irx6Q9ER75 438 aa6,4□□□□□ -1,38
Xirp2-201ENSMUST00000028410 MyclP10166 368 aa6,39□□□□□ -1,39
Xirp2-201ENSMUST00000028410 Ccer2J3QPU5 274 aa6,38□□□□□ -1,39
Xirp2-201ENSMUST00000028410 BlmO88700 1416 aa6,38□□□□□ -1,39
Xirp2-201ENSMUST00000028410 Trim26Q99PN3 545 aa6,37□□□□□ -1,39
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