RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027752.14

Lamc1-201, Transcript of Laminin subunit gamma-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Lamc1, Length 7,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Rhox8Q6VSS7 320 aa26.64■■□□□ 1.86
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Lamc1-201ENSMUST00000027752 Cngb1E1AZ71 1325 aa24.23■■□□□ 1.47
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Wdr66E9Q743 1299 aa23.99■■□□□ 1.43
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Ube2uB1AUC4 352 aa23.88■■□□□ 1.41
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Zeb1Q64318 1117 aa23.57■■□□□ 1.36
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Lamc1-201ENSMUST00000027752 Amer1Q7TS75 1132 aa23.47■■□□□ 1.35
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Lamc1-201ENSMUST00000027752 Myt1lP97500 1187 aa23.02■■□□□ 1.28
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Slc24a1Q91WD8 1130 aa22.83■■□□□ 1.25
Lamc1-201ENSMUST00000027752 CenpbP27790 599 aa22.83■■□□□ 1.24
Lamc1-201ENSMUST00000027752 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa22.62■■□□□ 1.21
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Lamc1-201ENSMUST00000027752 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa22.58■■□□□ 1.21
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Lamc1-201ENSMUST00000027752 4933416C03RikQ3V063 378 aa22.31■■□□□ 1.16
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Lamc1-201ENSMUST00000027752 Neurod1Q60867 357 aa22.04■■□□□ 1.12
Lamc1-201ENSMUST00000027752 NrdcQ8BHG1 1161 aa22.02■■□□□ 1.12
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Lamc1-201ENSMUST00000027752 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa21.79■■□□□ 1.08
Lamc1-201ENSMUST00000027752 HrcG5E8J6 738 aa21.71■■□□□ 1.07
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Lamc1-201ENSMUST00000027752 Tnnt3Q9QZ47 272 aa21.7■■□□□ 1.06
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Lamc1-201ENSMUST00000027752 Pcgf6Q99NA9 353 aa21.53■■□□□ 1.04
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Lamc1-201ENSMUST00000027752 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa21.45■■□□□ 1.02
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Gm13697A2AK42 830 aa21.43■■□□□ 1.02
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Lamc1-201ENSMUST00000027752 Ccdc180J3QNE4 1664 aa21.28■■□□□ 1
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Lamc1-201ENSMUST00000027752 Lmod2Q3UHZ5 550 aa20.98■□□□□ 0.95
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Lamc1-201ENSMUST00000027752 Anp32aO35381 247 aa20.92■□□□□ 0.94
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Lamc1-201ENSMUST00000027752 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa20.87■□□□□ 0.93
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Lamc1-201ENSMUST00000027752 Fgd1P52734 960 aa20.3■□□□□ 0.84
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Trim26Q99PN3 545 aa20.26■□□□□ 0.83
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Anks4bQ8K3X6 423 aa20.22■□□□□ 0.83
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Irx6Q9ER75 438 aa20.21■□□□□ 0.83
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Trim44Q9QXA7 346 aa20.21■□□□□ 0.83
Lamc1-201ENSMUST00000027752 P3h3Q8CG70 732 aa20.2■□□□□ 0.82
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Znf326O88291 580 aa20.18■□□□□ 0.82
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Lamc1-201ENSMUST00000027752 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
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