RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027752.14

Lamc1-201, Transcript of Laminin subunit gamma-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Lamc1, Length 7,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Rhox8Q6VSS7 320 aa26.64■■□□□ 1.86
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa24.34■■□□□ 1.49
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Cngb1E1AZ71 1325 aa24.23■■□□□ 1.47
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Wdr66E9Q743 1299 aa23.99■■□□□ 1.43
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Ube2uB1AUC4 352 aa23.88■■□□□ 1.41
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Zeb1Q64318 1117 aa23.57■■□□□ 1.36
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Amer1Q7TS75 1132 aa23.47■■□□□ 1.35
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa23.39■■□□□ 1.33
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Gab3Q8BSM5 595 aa23.26■■□□□ 1.31
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Npm2Q80W85 207 aa23.16■■□□□ 1.3
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Myt1lP97500 1187 aa23.02■■□□□ 1.28
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Slc24a1Q91WD8 1130 aa22.83■■□□□ 1.25
Lamc1-201ENSMUST00000027752 CenpbP27790 599 aa22.83■■□□□ 1.24
Lamc1-201ENSMUST00000027752 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa22.62■■□□□ 1.21
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Trim41Q5NCC3 630 aa22.61■■□□□ 1.21
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa22.58■■□□□ 1.21
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Stra8P70278 393 aa22.51■■□□□ 1.19
Lamc1-201ENSMUST00000027752 UbtfP25976 765 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
Lamc1-201ENSMUST00000027752 4933416C03RikQ3V063 378 aa22.31■■□□□ 1.16
Lamc1-201ENSMUST00000027752 NefmP08553 848 aa22.23■■□□□ 1.15
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Neurod1Q60867 357 aa22.04■■□□□ 1.12
Lamc1-201ENSMUST00000027752 NrdcQ8BHG1 1161 aa22.02■■□□□ 1.12
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
Lamc1-201ENSMUST00000027752 NeflP08551 543 aa22■■□□□ 1.11
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Os9Q8K2C7 672 aa21.96■■□□□ 1.11
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Il27Q8K3I6 234 aa21.95■■□□□ 1.1
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Myt1Q8CFC2 1127 aa21.84■■□□□ 1.09
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
Lamc1-201ENSMUST00000027752 NclP09405 707 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa21.79■■□□□ 1.08
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa21.79■■□□□ 1.08
Lamc1-201ENSMUST00000027752 HrcG5E8J6 738 aa21.71■■□□□ 1.07
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Plppr3Q7TPB0 716 aa21.7■■□□□ 1.06
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Tnnt3Q9QZ47 272 aa21.7■■□□□ 1.06
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Chic1Q8CBW7 227 aa21.62■■□□□ 1.05
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Pcgf6Q99NA9 353 aa21.53■■□□□ 1.04
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa21.47■■□□□ 1.03
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa21.45■■□□□ 1.02
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Gm13697A2AK42 830 aa21.43■■□□□ 1.02
Lamc1-201ENSMUST00000027752 TonslQ6NZL6 1363 aa21.29■■□□□ 1
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Ccdc180J3QNE4 1664 aa21.28■■□□□ 1
Lamc1-201ENSMUST00000027752 DaxxO35613 739 aa21.26■□□□□ 0.99
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Rtl5Q5DTT4 599 aa21.25■□□□□ 0.99
Lamc1-201ENSMUST00000027752 NischQ80TM9 1593 aa21.23■□□□□ 0.99
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Zbtb4Q5F293 982 aa21.18■□□□□ 0.98
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Atp1b4Q99ME6 356 aa21.14■□□□□ 0.97
Lamc1-201ENSMUST00000027752 ArxO35085 564 aa21.11■□□□□ 0.97
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Polr3glQ8R0C0 218 aa21.1■□□□□ 0.97
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa21.1■□□□□ 0.97
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Nlrp6Q91WS2 869 aa21.04■□□□□ 0.96
Lamc1-201ENSMUST00000027752 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Rtl1Q7M732 1744 aa21■□□□□ 0.95
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Erich6D3Z6S9 713 aa21■□□□□ 0.95
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Lmod2Q3UHZ5 550 aa20.98■□□□□ 0.95
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Gm13695A2AK44 830 aa20.96■□□□□ 0.95
Lamc1-201ENSMUST00000027752 CatipB9EKE5 520 aa20.94■□□□□ 0.94
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Anp32aO35381 247 aa20.92■□□□□ 0.94
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Mier1Q5UAK0 511 aa20.91■□□□□ 0.94
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa20.87■□□□□ 0.93
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Csrnp3P59055 597 aa20.79■□□□□ 0.92
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa20.78■□□□□ 0.92
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Gm38655A0A286YDK6 273 aa20.75■□□□□ 0.91
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Lmod3E9QA62 571 aa20.69■□□□□ 0.9
Lamc1-201ENSMUST00000027752 ClspnQ80YR7 1315 aa20.68■□□□□ 0.9
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa20.62■□□□□ 0.89
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Eid3Q3V124 375 aa20.53■□□□□ 0.88
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Vsig10D3YX43 558 aa20.52■□□□□ 0.88
Lamc1-201ENSMUST00000027752 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa20.44■□□□□ 0.86
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Abcc9P70170 1546 aa20.43■□□□□ 0.86
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa20.39■□□□□ 0.85
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Calr4Q3TQS0 420 aa20.31■□□□□ 0.84
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Fgd1P52734 960 aa20.3■□□□□ 0.84
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Trim26Q99PN3 545 aa20.26■□□□□ 0.83
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Anks4bQ8K3X6 423 aa20.22■□□□□ 0.83
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Irx6Q9ER75 438 aa20.21■□□□□ 0.83
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Trim44Q9QXA7 346 aa20.21■□□□□ 0.83
Lamc1-201ENSMUST00000027752 P3h3Q8CG70 732 aa20.2■□□□□ 0.82
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Znf326O88291 580 aa20.18■□□□□ 0.82
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Sall2Q9QX96 1004 aa20.16■□□□□ 0.82
Lamc1-201ENSMUST00000027752 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.4 ms