RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRTM3Q86VH5 581 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 MIER2Q8N344 545 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 AMER2Q8N7J2 671 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PJA1Q8NG27 643 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 C19orf60Q96EN9 201 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 YIPF4Q9BSR8 244 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PORCNQ9H237 461 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TXNRD2Q9NNW7 524 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ACOT13Q9NPJ3 140 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 DIABLOQ9NR28 239 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 KLHL20Q9Y2M5 609 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 E5RI56 91 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 BCKDKO14874 412 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PDGFAP04085 211 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 EDN1P05305 212 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 NR3C2P08235 984 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP2C8P10632 490 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP4B1P13584 511 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 MSH3P20585 1137 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 NMBRP28336 390 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC35A2P78381 396 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 CHRNB3Q05901 458 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 CSHL1Q14406 222 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 IRF3Q14653 427 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PON2Q15165 354 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 BTBD16Q32M84 506 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ZPBP2Q6X784 338 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM48Q8IWZ4 208 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 NRSN1Q8IZ57 195 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC01465Q8N7H1 131 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM86B1Q8N7N1 296 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ITFG1Q8TB96 612 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 RHOJQ9H4E5 214 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF146Q9NTX7 359 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 GLTPQ9NZD2 209 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 I3L521 148 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNK1O00180 336 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 MFSD11O43934 449 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 HPRP00739 348 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 CST1P01037 141 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 AHSGP02765 367 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PRKCBP05771 671 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ITGA2P17301 1181 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 GADD45AP24522 165 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 SDC4P31431 198 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 LIPAP38571 399 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 DSTNP60981 165 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB10P61026 200 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 CTBP1Q13363 440 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PAGE3Q5JUK9 113 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKS3Q6ZW76 656 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 DENND6AQ8IWF6 608 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF567Q8N184 647 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM199Q8N511 208 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXO30Q8TB52 745 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFAND1Q8TCF1 268 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM143Q96AN5 459 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ATG4CQ96DT6 458 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
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RABGEF1-203ENST00000439720 CSPG4P5Q96PW8 444 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2A14Q96R47 310 aa8.24□□□□□ -1.09
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RABGEF1-203ENST00000439720 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 MUC13Q9H3R2 512 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TMLHEQ9NVH6 421 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 OBP2AQ9NY56 170 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ATPIF1Q9UII2 106 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 UTS2RQ9UKP6 389 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TPRKBQ9Y3C4 175 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 U3KQV3 271 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 A8MT66 165 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 K7ERI5 159 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 DFFAO00273 331 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TSC22D2O75157 780 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
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