RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383872.1

RNU6-841P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 841, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-841P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-841P-201ENST00000383872 UCP3P55916 312 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 CLDN10P78369 228 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 CD69Q07108 199 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 AP1B1Q10567 949 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 PRKAA1Q13131 559 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 RIPK1Q13546 671 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 PPP1R3AQ16821 1122 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 TMEM266Q2M3C6 531 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 CCDC57Q2TAC2 916 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 DEFB109BQ30KR1 87 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 FBXO43Q4G163 708 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 ZNF569Q5MCW4 686 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 MYSM1Q5VVJ2 828 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 CCDC102BQ68D86 513 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 LGALS9CQ6DKI2 356 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 MTFR2Q6P444 385 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 RFWD3Q6PCD5 774 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 C16orf87Q6PH81 154 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 VSTM1Q6UX27 236 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 TPTE2Q6XPS3 522 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 DTHD1Q6ZMT9 781 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 DET1Q7L5Y6 550 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 OTOP3Q7RTS5 596 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 CDH26Q8IXH8 852 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 DRC7Q8IY82 874 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 PRSS58Q8IYP2 241 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 C7orf61Q8IZ16 206 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 NLGN4XQ8N0W4 816 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 LRRC43Q8N309 656 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 RCBTB1Q8NDN9 531 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 OR6T1Q8NGN1 323 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 PATE1Q8WXA2 126 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 RLN3Q8WXF3 142 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 USP6NLQ92738 828 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 HAS2Q92819 552 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 FAM136AQ96C01 138 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 FAF2Q96CS3 445 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 MTBPQ96DY7 904 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 PIK3IP1Q96FE7 263 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 VSIG2Q96IQ7 327 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 SIN3AQ96ST3 1273 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 PCDHB18PQ96TA0 734 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 PAAF1Q9BRP4 392 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 TINF2Q9BSI4 451 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 TMEM70Q9BUB7 260 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 NUP58Q9BVL2 599 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 NMUR2Q9GZQ4 415 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 ZMYND12Q9H0C1 365 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 P2RY12Q9H244 342 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 TPK1Q9H3S4 243 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 WDCPQ9H6R7 721 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 NPHS2Q9NP85 383 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 NGBQ9NPG2 151 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 CUTCQ9NTM9 273 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 OSER1Q9NX31 292 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 FAM13BQ9NYF5 915 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 REV1Q9UBZ9 1251 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 ZNF212Q9UDV6 495 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 CAPN11Q9UMQ6 739 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 GABRQQ9UN88 632 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 YIPF1Q9Y548 306 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 SNX9Q9Y5X1 595 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 FHOD1Q9Y613 1164 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 ACTL7AQ9Y615 435 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 TEX264Q9Y6I9 313 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 A3GALT2U3KPV4 340 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 NUMA1Q14980 2115 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 PTPRCP08575 1304 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-841P-201ENST00000383872 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms