RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453724.5

RPE-215, Transcript of ribulose-5-phosphate-3-epimerase, humanhuman

TSL 5

Gene RPE, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE-215ENST00000453724 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 MGAT4DA6NG13 374 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 PRR19A6NJB7 356 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 TP73O15350 636 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 YY2O15391 372 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 FFAR2O15552 330 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 SH3BP5O60239 455 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 UGT1A9O60656 530 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 AVILO75366 819 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 NDUFS3O75489 264 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 VAPBO95292 243 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 TRIM16O95361 564 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 ESR1P03372 595 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 F3P13726 295 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 GLB1P16278 677 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 CKMT2P17540 419 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 UGT1A6P19224 532 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 IDSP22304 550 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 UGT1A1P22309 533 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 UGT1A4P22310 534 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 ARNTP27540 789 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 NMBRP28336 390 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 UGT1A3P35503 534 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 UGT1A5P35504 534 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 ACTR1BP42025 376 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 HALP42357 657 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 MAPK9P45984 424 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 GPR3P46089 330 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 FASLGP48023 281 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 ARSDP51689 593 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 ACTR1AP61163 376 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 DAB2P98082 770 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 CTBSQ01459 385 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 BNIP3Q12983 259 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 TMED2Q15363 201 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 DBN1Q16643 649 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 PROX2Q3B8N5 592 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 BBS9Q3SYG4 887 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 C14orf28Q4W4Y0 310 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 ZNF542PQ5EBM4 170 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 ZNF470Q6ECI4 717 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 NEPROQ6NW34 567 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 CYS1Q717R9 158 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 KCNMB4Q86W47 210 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 GATAD2AQ86YP4 633 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 CILP2Q8IUL8 1156 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 RELL1Q8IUW5 271 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 ZNF547Q8IVP9 402 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 IFT20Q8IY31 132 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 PIANPQ8IYJ0 282 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 SLC25A45Q8N413 288 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 EID2Q8N6I1 236 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 OTUD6BQ8N6M0 293 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 OR2L2Q8NH16 312 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 GSDMBQ8TAX9 411 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 PYROXD1Q8WU10 500 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 GATA6Q92908 595 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 SH3KBP1Q96B97 665 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 MFSD3Q96ES6 412 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 CERS2Q96G23 380 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 ZNF778Q96MU6 729 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 FMO2Q99518 471 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 CCM2Q9BSQ5 444 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 LRRC1Q9BTT6 524 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 DPH5Q9H2P9 285 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 DPEP2Q9H4A9 486 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 UCK1Q9HA47 277 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 UGT1A7Q9HAW7 530 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 UGT1A10Q9HAW8 530 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 UGT1A8Q9HAW9 530 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 TAAR2Q9P1P5 351 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 ACSL5Q9ULC5 683 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 SNX24Q9Y343 169 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 GPSM3Q9Y4H4 160 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 MAST4O15021 2626 aa6.12□□□□□ -1.43
RPE-215ENST00000453724 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
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