RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411094.1

RN7SKP247-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 247, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP247, Length 308 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP247-201ENST00000411094 PTPN22Q9Y2R2 807 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 FKBP7Q9Y680 259 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 MAU2Q9Y6X3 613 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 X6R8D5 127 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 FHOD3Q2V2M9 1422 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 MRC2Q9UBG0 1479 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 A0A075B6Q4 140 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 PQLC2LA1A4F0 135 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 C5orf60A6NFR6 353 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 MFSD2BA6NFX1 497 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 USP27XA6NNY8 438 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 C22orf46C9J442 243 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 NPIPA2E9PIF3 369 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 CLDN4O14493 209 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 LDLRAD4O15165 306 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 SLC31A2O15432 143 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 ADCY6O43306 1168 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 DDNO94850 711 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 CAMTA2O94983 1202 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 OAZ2O95190 189 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 AHSA1O95433 338 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 DIRAS3O95661 229 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 MT-CO1P00395 513 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 HMGCRP04035 888 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 FCER2P06734 321 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 LIPFP07098 398 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 INHBAP08476 426 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 PLA2G4BP0C869 781 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 SPATA31D3P0C874 917 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 RNF224P0DH78 156 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 TCF4P15884 667 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 SDHBP21912 280 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 TACR1P25103 407 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 YWHAQP27348 245 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 RBL1P28749 1068 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 CD1BP29016 333 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 CRABP1P29762 137 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 CD40LGP29965 261 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 CCND2P30279 289 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 CDC25AP30304 524 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 OXTRP30559 389 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 HOXA9P31269 272 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 STX2P32856 288 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 CAPGP40121 348 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 SLC1A3P43003 542 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 OR3A3P47888 321 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 ALDH3B2P48448 385 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 SLC11A1P49279 550 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 SLC11A2P49281 568 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 MEOX2P50222 304 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 RAB13P51153 203 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 CLCNKAP51800 687 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 VAV2P52735 878 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 ITGA8P53708 1063 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 EPHB3P54753 998 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 CASP6P55212 293 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 SLC3A1Q07837 685 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 PUDPQ08623 228 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 FSTL1Q12841 308 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 SLC39A6Q13433 755 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 TP53BP2Q13625 1128 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 ZNF460Q14592 562 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 ITIH4Q14624 930 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 KIR3DS1Q14943 382 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 SEC23BQ15437 767 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 PPP1R3AQ16821 1122 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 TMEM119Q4V9L6 283 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 MANEAQ5SRI9 462 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 LCN1P1Q5VSP4 162 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 FAM160B1Q5W0V3 765 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 ATG16L1Q676U5 607 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 BICRALQ6AI39 1079 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 MTFR2Q6P444 385 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 SYCE2Q6PIF2 218 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 IL20RBQ6UXL0 311 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 SSX9Q7RTT3 188 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 IQCHQ86VS3 1027 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 METTL23Q86XA0 190 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 C2CD5Q86YS7 1000 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 RASAL3Q86YV0 1011 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 SP8Q8IXZ3 490 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 ADSSL1Q8N142 457 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 CENPSQ8N2Z9 138 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 ZNF786Q8N393 782 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 GLIS1Q8NBF1 620 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 LEMD2Q8NC56 503 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 NETO2Q8NC67 525 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 CCDC197Q8NCU1 140 aa4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms