RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	YML037C	Q03703	340 aa		6.48	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	6.47	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	BSD2	P38356	321 aa		6.47	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	RET3	P53600	189 aa		6.47	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	TIP41	Q12199	356 aa		6.47	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	HVG1	P0CE11	249 aa		6.47	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.47	□□□□□ -1.37	not detected
AMD1	YML035C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	6.47	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	6.47	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	NET1	P47035	1189 aa		6.47	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	TCB2	P48231	1178 aa		6.47	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	PEX29	Q03370	554 aa		6.47	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	FBP1	P09201	348 aa		6.46	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	RKM3	P38222	552 aa		6.46	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	ASE1	P50275	885 aa		6.46	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	SUE1	Q06524	206 aa		6.46	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	ARP8	Q12386	881 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.46	□□□□□ -1.38	not detected
AMD1	YML035C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		6.46	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	RAD18	P10862	487 aa		6.46	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	SAS3	P34218	831 aa		6.46	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	RSM25	P40496	264 aa		6.46	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	SSL2	Q00578	843 aa		6.46	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	GIS4	Q04233	774 aa		6.46	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	UBX5	Q06682	500 aa		6.46	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	6.45	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	6.45	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	6.45	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	ALG1	P16661	449 aa		6.45	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	6.45	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	TGL1	P34163	548 aa		6.45	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	6.45	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	LEO1	P38439	464 aa		6.45	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	PAN5	P38787	379 aa		6.45	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	YJL007C	P47080	104 aa		6.45	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	6.45	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	6.45	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	6.45	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	LCD1	Q04377	747 aa		6.45	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	CSC1	Q06538	782 aa		6.45	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	GUD1	Q07729	489 aa		6.45	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	6.45	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	MCM2	P29469	868 aa		6.45	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	YKR018C	P36114	725 aa		6.45	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	6.45	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	RTC4	P53850	401 aa		6.45	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	RBA50	Q04418	439 aa		6.45	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	CST9	Q06032	482 aa		6.45	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	YOR296W	Q08748	1289 aa		6.45	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	PTC5	Q12511	572 aa		6.45	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	RPN12	P32496	274 aa		6.44	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	UGA4	P32837	571 aa		6.44	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	YPT11	P48559	417 aa		6.44	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	RGP1	P16664	663 aa		6.44	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	MCD4	P36051	919 aa		6.44	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	FMS1	P50264	508 aa		6.44	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	DSE4	P53753	1117 aa		6.44	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	CSM3	Q04659	317 aa		6.44	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	YAF9	P53930	226 aa		6.43	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	SPH1	Q06160	661 aa		6.43	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	GPB2	P39717	880 aa		6.42	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	YGR153W	P48238	217 aa		6.42	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	TRS33	Q99394	268 aa		6.42	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	ERG7	P38604	731 aa		6.42	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	RSC30	P38781	883 aa		6.42	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	NDT80	P38830	627 aa		6.42	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	DAK2	P43550	591 aa		6.42	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	LIF1	P53150	421 aa		6.42	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	TRS120	Q04183	1289 aa		6.42	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	MMR1	Q06324	491 aa		6.42	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	TFC8	Q12308	588 aa		6.42	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	6.41	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	MIC60	P36112	540 aa		6.41	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	SUL1	P38359	859 aa		6.41	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	GAA1	P39012	614 aa		6.41	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	ATG32	P40458	529 aa		6.41	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	CIT3	P43635	486 aa		6.41	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	MFM1	Q02783	413 aa		6.41	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.41	□□□□□ -1.38	not detected
AMD1	YML035C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	6.41	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	PKC1	P24583	1151 aa		6.41	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	6.41	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	6.41	□□□□□ -1.38

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