RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W ALD3P54114 506 aa3.17□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W SLM3Q12093 417 aa3.17□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W APC1P53886 1748 aa3.16□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W FUS1P11710 512 aa3.16□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W ELM1P32801 640 aa3.16□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W IRS4P36115 615 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W AIM46P38885 310 aa3.16□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W LEM3P42838 414 aa3.16□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W SOG2Q08817 791 aa3.16□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W SPT7P35177 1332 aa3.16□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W RAD55P38953 406 aa3.16□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W INP51P40559 946 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W SUT1P53032 299 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W GUP1P53154 560 aa3.16□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W DUS1P53759 423 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W SQS1P53866 767 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W UFD2P54860 961 aa3.16□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W TIF6Q12522 245 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W SSM4P40318 1319 aa3.16□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W COQ2P32378 372 aa3.15□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W KAE1P36132 386 aa3.15□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W GEF1P37020 779 aa3.15□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W TOS1P38288 455 aa3.15□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W PSY2P40164 858 aa3.15□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W ARI1P53111 347 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W BIO5P53744 561 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W KIN4Q01919 800 aa3.15□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W KAR5Q04746 504 aa3.15□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa3.14□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W HVG1P0CE11 249 aa3.14□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W CDC3P32457 520 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W RRM3P38766 723 aa3.14□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W GIP2P40036 548 aa3.14□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W ACF4P47129 309 aa3.14□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W TAF8Q03750 510 aa3.14□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W TY4A-HQ6Q5P6 413 aa3.14□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W MHP1P43638 1398 aa3.14□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W RIM15P43565 1770 aa3.14□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W CTT1P06115 562 aa3.14□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W TFA2P36145 328 aa3.14□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W QDR1P40475 563 aa3.14□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W XKS1P42826 600 aa3.14□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W SAP155P43612 1002 aa3.14□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data3.13□□□□□ -1.91not detected
SSQ1YLR369W ETP1P38748 585 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W UBP5P39944 805 aa3.13□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W DSE4P53753 1117 aa3.13□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W RSC4Q02206 625 aa3.13□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W GIS1Q03833 894 aa3.13□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W YLR122CQ12312 125 aa3.13□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W POM152P39685 1337 aa3.13□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W TRL1P09880 827 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W GLO3P38682 493 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W TED1P40533 473 aa3.12□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W SOK2P53438 785 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W NAP1P25293 417 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W PYC2P32327 1180 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W ERT1P38140 529 aa3.12□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W ENP1P38333 483 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W PAF1P38351 445 aa3.12□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W PAN5P38787 379 aa3.12□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W PRP43P53131 767 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W TRS120Q04183 1289 aa3.12□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W BRE4Q07660 1125 aa3.12□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W GLO4Q12320 285 aa3.12□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W YLR278CQ05854 1341 aa3.11□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W RSC6P25632 483 aa3.11□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W SPO71Q03868 1245 aa3.11□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W BUG1Q12191 341 aa3.11□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W YKL222CP35995 705 aa3.11□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W POL5P39985 1022 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W CTR9P89105 1077 aa3.11□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W MSH6Q03834 1242 aa3.11□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W MNL2Q12205 849 aa3.11□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W YJR124CP47159 448 aa3.1□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W YNR065CP53751 1116 aa3.1□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W ADE16P54113 591 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W CDC55Q00362 526 aa3.1□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W RPO41P13433 1351 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W RAD4P14736 754 aa3.09□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W RIM11P38615 370 aa3.09□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W FET4P40988 552 aa3.09□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W YGR130CP53278 816 aa3.09□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W HAS1Q03532 505 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W RIX7Q07844 837 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SSQ1YLR369W RNQ1P25367 405 aa3.09□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W ERP5P38819 212 aa3.09□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W MDJ2P42834 146 aa3.09□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W YNL011CP53980 444 aa3.09□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W BSC2Q05611 235 aa3.09□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W ELG1Q12050 791 aa3.09□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W REC8Q12188 680 aa3.09□□□□□ -1.92
SSQ1YLR369W YBL113CQ7M4S9 792 aa3.09□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.8 ms