RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSQ1	YLR369W	ALD3	P54114	506 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SSQ1	YLR369W	SLM3	Q12093	417 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SSQ1	YLR369W	APC1	P53886	1748 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSQ1	YLR369W	FUS1	P11710	512 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSQ1	YLR369W	ELM1	P32801	640 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSQ1	YLR369W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SSQ1	YLR369W	AIM46	P38885	310 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSQ1	YLR369W	LEM3	P42838	414 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSQ1	YLR369W	SOG2	Q08817	791 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSQ1	YLR369W	SPT7	P35177	1332 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSQ1	YLR369W	RAD55	P38953	406 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSQ1	YLR369W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SSQ1	YLR369W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SSQ1	YLR369W	GUP1	P53154	560 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSQ1	YLR369W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SSQ1	YLR369W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SSQ1	YLR369W	UFD2	P54860	961 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSQ1	YLR369W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SSQ1	YLR369W	SSM4	P40318	1319 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSQ1	YLR369W	COQ2	P32378	372 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	KAE1	P36132	386 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	GEF1	P37020	779 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	TOS1	P38288	455 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	PSY2	P40164	858 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	KIN4	Q01919	800 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	KAR5	Q04746	504 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	HVG1	P0CE11	249 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	RRM3	P38766	723 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	GIP2	P40036	548 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	ACF4	P47129	309 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	TAF8	Q03750	510 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	MHP1	P43638	1398 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	RIM15	P43565	1770 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	CTT1	P06115	562 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	TFA2	P36145	328 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	QDR1	P40475	563 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	XKS1	P42826	600 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	SAP155	P43612	1002 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.13	□□□□□ -1.91	not detected
SSQ1	YLR369W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	UBP5	P39944	805 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	DSE4	P53753	1117 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	RSC4	Q02206	625 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	GIS1	Q03833	894 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	YLR122C	Q12312	125 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	POM152	P39685	1337 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	TED1	P40533	473 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	ERT1	P38140	529 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	PAF1	P38351	445 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	PAN5	P38787	379 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	TRS120	Q04183	1289 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	BRE4	Q07660	1125 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	GLO4	Q12320	285 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	YLR278C	Q05854	1341 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	RSC6	P25632	483 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	SPO71	Q03868	1245 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	BUG1	Q12191	341 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	YKL222C	P35995	705 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	CTR9	P89105	1077 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	MSH6	Q03834	1242 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	MNL2	Q12205	849 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	YJR124C	P47159	448 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	YNR065C	P53751	1116 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	CDC55	Q00362	526 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	RAD4	P14736	754 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	RIM11	P38615	370 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	FET4	P40988	552 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	YGR130C	P53278	816 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SSQ1	YLR369W	RNQ1	P25367	405 aa		3.09	□□□□□ -1.92
SSQ1	YLR369W	ERP5	P38819	212 aa		3.09	□□□□□ -1.92
SSQ1	YLR369W	MDJ2	P42834	146 aa		3.09	□□□□□ -1.92
SSQ1	YLR369W	YNL011C	P53980	444 aa		3.09	□□□□□ -1.92
SSQ1	YLR369W	BSC2	Q05611	235 aa		3.09	□□□□□ -1.92
SSQ1	YLR369W	ELG1	Q12050	791 aa		3.09	□□□□□ -1.92
SSQ1	YLR369W	REC8	Q12188	680 aa		3.09	□□□□□ -1.92
SSQ1	YLR369W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		3.09	□□□□□ -1.92

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