RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	RAD59	Q12223	238 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	MSC7	P38694	644 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	UBP12	P39538	1254 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	MXR1	P40029	184 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	TUS1	Q06412	1307 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.21	□□□□□ -1.26	not detected
SYF2	YGR129W	YHR131C	P38835	850 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	YGR122W	P53272	402 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	PCL8	Q08966	492 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	KIN1	P13185	1064 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	SWC3	P31376	625 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	FIG4	P42837	879 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	YJR107W	P47145	328 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	MET7	Q08645	548 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	MIP1	P15801	1254 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	ACO2	P39533	789 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	AAD14	P42884	376 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	NSG2	P53898	299 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	PKC1	P24583	1151 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	YIR042C	P40586	236 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	SCW11	P53189	542 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	INM2	Q05533	292 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	EUG1	P32474	517 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	MDL2	P33311	773 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	UBX5	Q06682	500 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	TEC1	P18412	486 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	PER1	P25625	357 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	BCS1	P32839	456 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	KTR2	P33550	425 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	LSC2	P53312	427 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	YNR014W	P53719	212 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
SYF2	YGR129W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	RAD24	P32641	659 aa		7.14	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	MKS1	P34072	584 aa		7.14	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		7.14	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	RGT1	P32862	1170 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	GPB2	P39717	880 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	YIR007W	P40566	764 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	ECM29	P38737	1868 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	YJR098C	P47139	656 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	DFG5	Q05031	458 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	DUS4	Q06063	367 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	LAP2	Q10740	671 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	RRI2	Q12348	645 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	TOR1	P35169	2470 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	IRE1	P32361	1115 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	CST26	P38226	397 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	BOI2	P39969	1040 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	PIP2	P52960	996 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	UBP2	Q01476	1272 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	YML037C	Q03703	340 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	UBR2	Q07963	1872 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	YAF9	P53930	226 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	YPR084W	Q06821	456 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	PIF1	P07271	859 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	SLA1	P32790	1244 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	YGR035C	P53222	116 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	YNL193W	P53870	558 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
SYF2	YGR129W	CYB2	P00175	591 aa		7.08	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	SKP2	P42843	763 aa		7.08	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	GUT2	P32191	649 aa		7.07	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	FBP26	P32604	452 aa		7.07	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	JHD1	P40034	492 aa		7.07	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	YPP1	P46951	817 aa		7.07	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	YDL144C	Q07589	356 aa		7.07	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	BDS1	Q08347	646 aa		7.07	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	DAP1	Q12091	152 aa		7.07	□□□□□ -1.28

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