RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
VFA1YER128W LAP2Q10740 671 aa4.68□□□□□ -1.66
VFA1YER128W YLR358CO13565 187 aa4.67□□□□□ -1.66
VFA1YER128W ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
VFA1YER128W YRB30P53107 440 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
VFA1YER128W RSA3Q05942 220 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
VFA1YER128W SRO9P25567 434 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
VFA1YER128W UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data4.66□□□□□ -1.66not detected
VFA1YER128W UTP5Q04177 643 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
VFA1YER128W YOR352WQ08816 343 aa4.66□□□□□ -1.66
VFA1YER128W SHM2P37291 469 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
VFA1YER128W GRS1P38088 690 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
VFA1YER128W XKS1P42826 600 aa4.65□□□□□ -1.67
VFA1YER128W SAM37P50110 327 aa4.65□□□□□ -1.67
VFA1YER128W NOG1Q02892 647 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
VFA1YER128W TUB2P02557 457 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
VFA1YER128W TRL1P09880 827 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
VFA1YER128W PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data4.64□□□□□ -1.67not detected
VFA1YER128W MSH3P25336 1018 aa4.64□□□□□ -1.67
VFA1YER128W CTS1P29029 562 aa4.64□□□□□ -1.67
VFA1YER128W YJL045WP47052 634 aa4.64□□□□□ -1.67
VFA1YER128W YCS4Q06156 1176 aa4.64□□□□□ -1.67
VFA1YER128W CIC1P38779 376 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
VFA1YER128W YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
VFA1YER128W ENV11P53246 860 aa4.63□□□□□ -1.67
VFA1YER128W YNR063WP53749 607 aa4.63□□□□□ -1.67
VFA1YER128W PEX13P80667 386 aa4.63□□□□□ -1.67
VFA1YER128W NBA1Q08229 501 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
VFA1YER128W SPS1P08458 490 aa4.62□□□□□ -1.67
VFA1YER128W GPI13Q07830 1017 aa4.62□□□□□ -1.67
VFA1YER128W RSC58Q07979 502 aa4.62□□□□□ -1.67
VFA1YER128W VMA4P22203 233 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
VFA1YER128W QNS1P38795 714 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
VFA1YER128W RPS0BP46654 252 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
VFA1YER128W SPT20P50875 604 aa4.61□□□□□ -1.67
VFA1YER128W PNS1Q12412 539 aa4.61□□□□□ -1.67
VFA1YER128W RLF2Q12495 606 aa4.61□□□□□ -1.67
VFA1YER128W FRT1Q99332 602 aa4.61□□□□□ -1.67
VFA1YER128W YSC84P32793 468 aa4.6□□□□□ -1.67
VFA1YER128W MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data4.6□□□□□ -1.67not detected
VFA1YER128W RSM26P47141 266 aa4.6□□□□□ -1.67
VFA1YER128W YDR132CQ03900 495 aa4.6□□□□□ -1.67
VFA1YER128W SGD1Q06132 899 aa4.6□□□□□ -1.67
VFA1YER128W SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data4.59□□□□□ -1.67not detected
VFA1YER128W SQT1P35184 431 aa4.59□□□□□ -1.67
VFA1YER128W ERP5P38819 212 aa4.59□□□□□ -1.67
VFA1YER128W TAT2P38967 592 aa4.59□□□□□ -1.67
VFA1YER128W MDJ2P42834 146 aa4.59□□□□□ -1.67
VFA1YER128W VPS53P47061 822 aa4.59□□□□□ -1.67
VFA1YER128W NUT2Q06213 157 aa4.59□□□□□ -1.67
VFA1YER128W COQ4O13525 335 aa4.58□□□□□ -1.68
VFA1YER128W LAM1P38851 1228 aa4.58□□□□□ -1.68
VFA1YER128W YBL113CQ7M4S9 792 aa4.58□□□□□ -1.68
VFA1YER128W TAD3Q9URQ3 322 aa4.58□□□□□ -1.68
VFA1YER128W KAR2P16474 682 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
VFA1YER128W NAP1P25293 417 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
VFA1YER128W PRP40P33203 583 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
VFA1YER128W CCZ1P38273 704 aa4.57□□□□□ -1.68
VFA1YER128W MEF2P39677 819 aa4.57□□□□□ -1.68
VFA1YER128W GCN5Q03330 439 aa4.57□□□□□ -1.68
VFA1YER128W RKM2Q03942 479 aa4.57□□□□□ -1.68
VFA1YER128W ADD66P36040 267 aa4.56□□□□□ -1.68
VFA1YER128W HNT2P49775 206 aa4.56□□□□□ -1.68
VFA1YER128W CYC1P00044 109 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
VFA1YER128W CDC3P32457 520 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
VFA1YER128W UGA4P32837 571 aa4.55□□□□□ -1.68
VFA1YER128W PEX28P38848 579 aa4.55□□□□□ -1.68
VFA1YER128W ULP1Q02724 621 aa4.55□□□□□ -1.68
VFA1YER128W RSB1Q08417 382 aa4.55□□□□□ -1.68
VFA1YER128W SSA1P10591 642 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
VFA1YER128W PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data4.54□□□□□ -1.68not detected
VFA1YER128W SEC26P41810 973 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
VFA1YER128W DAL4Q04895 635 aa4.54□□□□□ -1.68
VFA1YER128W RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
VFA1YER128W KIP1P28742 1111 aa4.53□□□□□ -1.68
VFA1YER128W GCD6P32501 712 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
VFA1YER128W TRM2P33753 639 aa4.53□□□□□ -1.68
VFA1YER128W ROT1Q03691 256 aa4.53□□□□□ -1.68
VFA1YER128W RDH54P38086 958 aa4.52□□□□□ -1.69
VFA1YER128W KRI1P42846 591 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
VFA1YER128W TNA1P53322 534 aa4.52□□□□□ -1.69
VFA1YER128W HOS3Q02959 697 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
VFA1YER128W PUS9Q12069 462 aa4.52□□□□□ -1.69
VFA1YER128W AIM44Q99299 758 aa4.52□□□□□ -1.69
VFA1YER128W VPS35P34110 944 aa4.51□□□□□ -1.69
VFA1YER128W MNN4P36044 1178 aa4.51□□□□□ -1.69
VFA1YER128W BAP2P38084 609 aa4.51□□□□□ -1.69
VFA1YER128W GPB2P39717 880 aa4.51□□□□□ -1.69
VFA1YER128W YGL140CP53120 1219 aa4.51□□□□□ -1.69
VFA1YER128W EST2Q06163 884 aa4.51□□□□□ -1.69
VFA1YER128W HAT1Q12341 374 aa4.51□□□□□ -1.69
VFA1YER128W DOM34P33309 386 aa4.5□□□□□ -1.69
VFA1YER128W PIK1P39104 1066 aa4.5□□□□□ -1.69
VFA1YER128W MSE1P48525 536 aa4.5□□□□□ -1.69
VFA1YER128W DUS4Q06063 367 aa4.5□□□□□ -1.69
VFA1YER128W PTC5Q12511 572 aa4.5□□□□□ -1.69
VFA1YER128W AFG2P32794 780 aa4.49□□□□□ -1.69
VFA1YER128W PLB2Q03674 706 aa4.49□□□□□ -1.69
VFA1YER128W RSM24Q03976 319 aa4.49□□□□□ -1.69
VFA1YER128W SPO21Q12411 609 aa4.49□□□□□ -1.69
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