RNA–Protein interactions for RNA: Q0140

VAR1, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene VAR1, Length 1,197 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	Q0140	YAF9	P53930	226 aa		7.24	□□□□□ -1.25
VAR1	Q0140	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
VAR1	Q0140	DOM34	P33309	386 aa		7.23	□□□□□ -1.25
VAR1	Q0140	TMA10	Q06177	86 aa		7.23	□□□□□ -1.25
VAR1	Q0140	RSC58	Q07979	502 aa		7.23	□□□□□ -1.25
VAR1	Q0140	LST4	P34239	828 aa		7.22	□□□□□ -1.25
VAR1	Q0140	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
VAR1	Q0140	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
VAR1	Q0140	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
VAR1	Q0140	PHO23	P50947	330 aa		7.21	□□□□□ -1.26
VAR1	Q0140	PLB2	Q03674	706 aa		7.21	□□□□□ -1.26
VAR1	Q0140	EXO5	P38289	585 aa		7.2	□□□□□ -1.26
VAR1	Q0140	NEM1	P38757	446 aa		7.2	□□□□□ -1.26
VAR1	Q0140	BOL3	P39724	118 aa		7.2	□□□□□ -1.26
VAR1	Q0140	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
VAR1	Q0140	PMT7	Q06644	662 aa		7.2	□□□□□ -1.26
VAR1	Q0140	YJL045W	P47052	634 aa		7.19	□□□□□ -1.26
VAR1	Q0140	STE11	P23561	717 aa		7.18	□□□□□ -1.26
VAR1	Q0140	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
VAR1	Q0140	YKL077W	P36081	392 aa		7.17	□□□□□ -1.26
VAR1	Q0140	NUT1	P53114	1132 aa		7.17	□□□□□ -1.26
VAR1	Q0140	CDC20	P26309	610 aa		7.16	□□□□□ -1.26
VAR1	Q0140	KIN4	Q01919	800 aa		7.16	□□□□□ -1.26
VAR1	Q0140	HNT2	P49775	206 aa		7.15	□□□□□ -1.26
VAR1	Q0140	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
VAR1	Q0140	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
VAR1	Q0140	FLP1	P03870	423 aa		7.14	□□□□□ -1.27
VAR1	Q0140	PPM2	Q08282	695 aa		7.13	□□□□□ -1.27
VAR1	Q0140	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
VAR1	Q0140	HSE1	P38753	452 aa		7.11	□□□□□ -1.27
VAR1	Q0140	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
VAR1	Q0140	YSC84	P32793	468 aa		7.09	□□□□□ -1.27
VAR1	Q0140	LEO1	P38439	464 aa		7.09	□□□□□ -1.27
VAR1	Q0140	UFD2	P54860	961 aa		7.09	□□□□□ -1.27
VAR1	Q0140	BDF2	Q07442	638 aa		7.09	□□□□□ -1.27
VAR1	Q0140	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
VAR1	Q0140	RXT3	Q07458	294 aa		7.08	□□□□□ -1.28
VAR1	Q0140	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
VAR1	Q0140	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
VAR1	Q0140	MSS4	P38994	779 aa		7.06	□□□□□ -1.28
VAR1	Q0140	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
VAR1	Q0140	BSC2	Q05611	235 aa		7.06	□□□□□ -1.28
VAR1	Q0140	LAP2	Q10740	671 aa		7.06	□□□□□ -1.28
VAR1	Q0140	CDC6	P09119	513 aa		7.05	□□□□□ -1.28
VAR1	Q0140	MON1	P53129	644 aa		7.05	□□□□□ -1.28
VAR1	Q0140	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
VAR1	Q0140	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
VAR1	Q0140	ATF1	P40353	525 aa		7.04	□□□□□ -1.28
VAR1	Q0140	XKS1	P42826	600 aa		7.04	□□□□□ -1.28
VAR1	Q0140	GPB1	Q08886	897 aa		7.04	□□□□□ -1.28
VAR1	Q0140	GAL10	P04397	699 aa		7.03	□□□□□ -1.28
VAR1	Q0140	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
VAR1	Q0140	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
VAR1	Q0140	YNR063W	P53749	607 aa		7.03	□□□□□ -1.28
VAR1	Q0140	SPO21	Q12411	609 aa		7.03	□□□□□ -1.28
VAR1	Q0140	SRM1	P21827	482 aa		7.02	□□□□□ -1.29
VAR1	Q0140	SHU2	P38957	223 aa		7.02	□□□□□ -1.29
VAR1	Q0140	OAR1	P35731	278 aa		7.01	□□□□□ -1.29
VAR1	Q0140	MOH1	P38191	138 aa		7.01	□□□□□ -1.29
VAR1	Q0140	YNL011C	P53980	444 aa		7.01	□□□□□ -1.29
VAR1	Q0140	CMP2	P14747	604 aa		6.99	□□□□□ -1.29
VAR1	Q0140	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
VAR1	Q0140	COQ4	O13525	335 aa		6.98	□□□□□ -1.29
VAR1	Q0140	DCG1	P32460	244 aa		6.98	□□□□□ -1.29
VAR1	Q0140	CCZ1	P38273	704 aa		6.98	□□□□□ -1.29
VAR1	Q0140	YAP6	Q03935	383 aa		6.98	□□□□□ -1.29
VAR1	Q0140	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
VAR1	Q0140	DMA2	P53924	522 aa		6.97	□□□□□ -1.29
VAR1	Q0140	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
VAR1	Q0140	UBA2	P52488	636 aa		6.96	□□□□□ -1.3
VAR1	Q0140	YLR224W	Q05947	369 aa		6.96	□□□□□ -1.3
VAR1	Q0140	RSB1	Q08417	382 aa		6.95	□□□□□ -1.3
VAR1	Q0140	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
VAR1	Q0140	MNL2	Q12205	849 aa		6.94	□□□□□ -1.3
VAR1	Q0140	ATG14	P38270	344 aa		6.93	□□□□□ -1.3
VAR1	Q0140	VPS62	P53285	467 aa		6.93	□□□□□ -1.3
VAR1	Q0140	BAP2	P38084	609 aa		6.92	□□□□□ -1.3
VAR1	Q0140	QDR1	P40475	563 aa		6.92	□□□□□ -1.3
VAR1	Q0140	CDC55	Q00362	526 aa		6.92	□□□□□ -1.3
VAR1	Q0140	RSM24	Q03976	319 aa		6.92	□□□□□ -1.3
VAR1	Q0140	MSH3	P25336	1018 aa		6.9	□□□□□ -1.3
VAR1	Q0140	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
VAR1	Q0140	VPS53	P47061	822 aa		6.88	□□□□□ -1.31
VAR1	Q0140	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	6.88	□□□□□ -1.31
VAR1	Q0140	GPB2	P39717	880 aa		6.87	□□□□□ -1.31
VAR1	Q0140	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	6.87	□□□□□ -1.31
VAR1	Q0140	EMC1	P25574	760 aa		6.86	□□□□□ -1.31
VAR1	Q0140	PIK1	P39104	1066 aa		6.86	□□□□□ -1.31
VAR1	Q0140	TNA1	P53322	534 aa		6.86	□□□□□ -1.31
VAR1	Q0140	TRS120	Q04183	1289 aa		6.86	□□□□□ -1.31
VAR1	Q0140	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.86	□□□□□ -1.31	not detected
VAR1	Q0140	KIP1	P28742	1111 aa		6.85	□□□□□ -1.31
VAR1	Q0140	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	6.85	□□□□□ -1.31
VAR1	Q0140	HMI1	Q12039	706 aa		6.85	□□□□□ -1.31
VAR1	Q0140	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	6.84	□□□□□ -1.31
VAR1	Q0140	GCV2	P49095	1034 aa		6.84	□□□□□ -1.31
VAR1	Q0140	PEX13	P80667	386 aa		6.84	□□□□□ -1.31
VAR1	Q0140	SNF5	P18480	905 aa		6.83	□□□□□ -1.32
VAR1	Q0140	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	6.83	□□□□□ -1.32
VAR1	Q0140	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	6.83	□□□□□ -1.32

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 100.6 ms