RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000194894.3

Ankrd39-202, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 39, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd39, Length 664 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Aplp2Q06335 707 aa23.7■■□□□ 1.38
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Znrd1-asQ8R0E5 213 aa23.69■■□□□ 1.38
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 ApobrQ8VBT6 942 aa23.69■■□□□ 1.38
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Bicdl1A0JNT9 577 aa23.67■■□□□ 1.38
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Fam122aQ9DB52 284 aa23.67■■□□□ 1.38
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Parp14Q2EMV9 1817 aa23.67■■□□□ 1.38
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa23.63■■□□□ 1.37
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Rnaseh2aQ9CWY8 301 aa23.63■■□□□ 1.37
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 ThemisQ8BGW0 636 aa23.62■■□□□ 1.37
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa23.62■■□□□ 1.37
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa23.61■■□□□ 1.37
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Sumf1Q8R0F3 372 aa23.61■■□□□ 1.37
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Simc1E9Q6E9 1354 aa23.61■■□□□ 1.37
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Slc4a1apE9PX68 744 aa23.59■■□□□ 1.37
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 NppbP40753 121 aa23.59■■□□□ 1.37
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Sned1Q70E20 1403 aa23.59■■□□□ 1.37
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Adgre1Q61549 931 aa23.58■■□□□ 1.37
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Slc24a1Q91WD8 1130 aa23.57■■□□□ 1.36
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 PappaQ8R4K8 1624 aa23.57■■□□□ 1.36
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Socs7Q8VHQ2 579 aa23.56■■□□□ 1.36
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 CoblQ5NBX1 1337 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Casz1Q9CWL2 1761 aa23.53■■□□□ 1.36
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Hoxd11P23813 323 aa23.52■■□□□ 1.36
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Camkk2Q8C078 588 aa23.52■■□□□ 1.36
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Kdm6aO70546 1401 aa23.51■■□□□ 1.35
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Cyp2c69E9PXC3 491 aa23.51■■□□□ 1.35
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Cyp2c40P56657 491 aa23.51■■□□□ 1.35
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Gm13023A2A8N2 498 aa23.5■■□□□ 1.35
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa23.49■■□□□ 1.35
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Gm7361D3Z6R1 267 aa23.49■■□□□ 1.35
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa23.49■■□□□ 1.35
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Gm1979E9QAN3 267 aa23.49■■□□□ 1.35
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Gm5862K7N5V5 267 aa23.49■■□□□ 1.35
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Gm10220K7N660 267 aa23.49■■□□□ 1.35
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Hoxb7P09024 217 aa23.49■■□□□ 1.35
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Spon1Q8VCC9 807 aa23.49■■□□□ 1.35
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ubr3Q5U430 1889 aa23.49■■□□□ 1.35
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Eya1P97767 591 aa23.48■■□□□ 1.35
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa23.48■■□□□ 1.35
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Rad17Q6NXW6 688 aa23.47■■□□□ 1.35
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa23.47■■□□□ 1.35
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa23.47■■□□□ 1.35
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Plch1Q4KWH5 1682 aa23.47■■□□□ 1.35
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Col11a2Q64739 1736 aa23.47■■□□□ 1.35
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 UtrnE9Q6R7 3430 aa23.46■■□□□ 1.35
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 CpzQ8R4V4 654 aa23.46■■□□□ 1.35
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Crb1Q8VHS2 1405 aa23.45■■□□□ 1.34
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Tmf1B9EKI3 1091 aa23.44■■□□□ 1.34
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 ArsiQ32KI9 573 aa23.44■■□□□ 1.34
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Taf1dQ9D4V4 322 aa23.44■■□□□ 1.34
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Smarcc1P97496 1104 aa23.43■■□□□ 1.34
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Slc5a1Q8C3K6 665 aa23.43■■□□□ 1.34
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Spata31d1bE9QA57 1361 aa23.42■■□□□ 1.34
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Cyp2c67Q569X9 491 aa23.42■■□□□ 1.34
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ints5Q8CHT3 1018 aa23.41■■□□□ 1.34
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Tgfb2P27090 414 aa23.4■■□□□ 1.34
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 FktnQ8R507 461 aa23.4■■□□□ 1.34
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Tns2Q8CGB6 1400 aa23.4■■□□□ 1.34
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Eif4a2P10630 407 aa23.39■■□□□ 1.33
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 SnrkQ8VDU5 748 aa23.39■■□□□ 1.33
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Atg3Q9CPX6 314 aa23.39■■□□□ 1.33
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Togaram1Q6A070 1776 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Akap2O54931 893 aa23.38■■□□□ 1.33
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Tlr8P58682 1032 aa23.38■■□□□ 1.33
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Asic4Q7TNS7 539 aa23.38■■□□□ 1.33
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Miga2Q8BK03 593 aa23.38■■□□□ 1.33
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Msh6P54276 1358 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Dcaf11Q91VU6 549 aa23.35■■□□□ 1.33
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 C4bP01029 1738 aa23.34■■□□□ 1.33
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Trpm3Q5F4S9 1721 aa23.33■■□□□ 1.33
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 1810065E05RikQ5NC41 235 aa23.33■■□□□ 1.33
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Phkg2Q9DB30 406 aa23.33■■□□□ 1.33
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 MpripP97434 1024 aa23.32■■□□□ 1.32
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 TrhQ62361 256 aa23.32■■□□□ 1.32
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Cyp2c68K7N6C2 491 aa23.31■■□□□ 1.32
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Dcaf5Q80T85 946 aa23.31■■□□□ 1.32
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Jmjd4Q8BFT6 427 aa23.31■■□□□ 1.32
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Cap2Q9CYT6 476 aa23.31■■□□□ 1.32
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Megf6Q80V70 1572 aa23.31■■□□□ 1.32
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 RtcbQ99LF4 505 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Pdzd9Q9D9M4 266 aa23.29■■□□□ 1.32
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 B4galnt4Q766D5 1034 aa23.28■■□□□ 1.32
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Plin1Q8CGN5 517 aa23.28■■□□□ 1.32
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 StrcQ8VIM6 1809 aa23.28■■□□□ 1.32
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Sos1Q62245 1319 aa23.27■■□□□ 1.32
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Podxl2Q8CAE9 603 aa23.26■■□□□ 1.31
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Pank3Q8R2W9 370 aa23.26■■□□□ 1.31
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 PrxO55103 1391 aa23.26■■□□□ 1.31
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Gtpbp6Q3U6U5 514 aa23.24■■□□□ 1.31
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ssfa2Q922B9 1252 aa23.24■■□□□ 1.31
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Inpp5dQ9ES52 1191 aa23.24■■□□□ 1.31
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Itgb4A2A863 1818 aa23.24■■□□□ 1.31
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Nedd4P46935 887 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38.1 ms