RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000179943.2

Sh3bp2-207, Transcript of SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp2, Length 2,935 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Hoxc9P09633 260 aa16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 TnrQ8BYI9 1358 aa16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 AU015836B2RUM3 263 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Tsen2Q6P7W5 460 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Parp14Q2EMV9 1817 aa16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Eif4a2P10630 407 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Ccne1Q61457 408 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Rsph6aQ8CDR2 708 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 ZgpatQ8VDM1 511 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Ggt6Q6PDE7 497 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Kcnn1Q9EQR3 537 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Card10P58660 1021 aa16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Nyap1Q6PFX7 833 aa16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Pdcl3Q8BVF2 240 aa16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Antxr1Q9CZ52 562 aa16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Phlpp2Q8BXA7 1320 aa16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 HdgfP51859 237 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Amotl2Q8K371 772 aa16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Dusp27Q148W8 1138 aa16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Ciz1Q8VEH2 845 aa16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 PalmQ9Z0P4 383 aa16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Rad17Q6NXW6 688 aa16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Znf541Q0GGX2 1363 aa16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Ptpn23Q6PB44 1692 aa16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Catsper2A2ARP9 588 aa16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Map7O88735 730 aa16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 AU019823E9PUQ3 292 aa16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Sema6bO54951 886 aa16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 MpripP97434 1024 aa16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Znf330Q922H9 316 aa16.46■□□□□ 0.22
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Slit2Q9R1B9 1521 aa16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Eya1P97767 591 aa16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Terf2O35144 541 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Plin1Q8CGN5 517 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Phf14Q9D4H9 881 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Mcm10Q0VBD2 885 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Ssh1Q76I79 1042 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 OptnQ8K3K8 584 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Kif2cQ922S8 721 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Cntnap1O54991 1385 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Mcm4P49717 862 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 CastP51125 788 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Hs1bp3Q3TC93 395 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Kif18aQ91WD7 886 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Cavin4A2AMM0 362 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 CrklP47941 303 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 RgmbQ7TQ33 436 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 MypopQ8R4U1 393 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Slx1bQ8BX32 270 aa16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Ccdc60Q8C4J0 545 aa16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Gtf2a1Q99PM3 378 aa16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Pard3Q99NH2 1333 aa16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Spef2Q8C9J3 1734 aa16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Cog6Q8R3I3 657 aa16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Plcb2A3KGF7 1181 aa16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Col15a1O35206 1367 aa16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Lrp6O88572 1613 aa16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Cypt2Q6P924 180 aa16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Ankrd50F7BE84 1390 aa16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Fchsd2Q3USJ8 740 aa16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 SkilQ60665 675 aa16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Pknox2Q8BG99 474 aa16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Nutm1Q8BHP2 1126 aa16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Eno4Q8C042 619 aa16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 TkfcQ8VC30 578 aa16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Psrc1Q9D0P7 329 aa16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Kdm6aO70546 1401 aa16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Kif20aP97329 887 aa16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 FocadA2AKG8 1798 aa16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Rfx1P48377 963 aa16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Slit1Q80TR4 1531 aa16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Gm10471E9Q1C7 252 aa16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Il4rP16382 810 aa16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Q4VA45 678 aa16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Zranb3Q6NZP1 1069 aa16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Emilin2Q8K482 1074 aa16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Zfp777B9EKF4 885 aa16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 Aplp1Q03157 653 aa16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10.3 ms