RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000120539.7

Lmo4-201, Transcript of LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Lmo4, Length 1,669 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Aox2Q5SGK3 1345 aa31.3■■■□□ 2.6
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Atxn3Q9CVD2 355 aa31.28■■■□□ 2.6
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Kcnh4A2A5F7 1018 aa31.27■■■□□ 2.6
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Snap23O09044 210 aa31.27■■■□□ 2.6
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ginm1Q91WR6 327 aa31.27■■■□□ 2.6
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Speer4bQ9D9F7 267 aa31.25■■■□□ 2.59
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Myo5bP21271 1818 aa31.25■■■□□ 2.59
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ankrd23Q812A3 306 aa31.25■■■□□ 2.59
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa31.23■■■□□ 2.59
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Sik1Q60670 779 aa31.23■■■□□ 2.59
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ccdc30Q8BVF4 654 aa31.23■■■□□ 2.59
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Fbln2P37889 1221 aa31.22■■■□□ 2.59
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Vps33bP59016 617 aa31.22■■■□□ 2.59
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Phkg2Q9DB30 406 aa31.22■■■□□ 2.59
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Pdzd9Q9D9M4 266 aa31.22■■■□□ 2.59
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Abcc12Q80WJ6 1366 aa31.2■■■□□ 2.58
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Sos1Q62245 1319 aa31.19■■■□□ 2.58
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
Lmo4-201ENSMUST00000120539 PappaQ8R4K8 1624 aa31.19■■■□□ 2.58
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Znf710Q3U288 666 aa31.17■■■□□ 2.58
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Exoc5Q3TPX4 708 aa31.16■■■□□ 2.58
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ssfa2Q922B9 1252 aa31.16■■■□□ 2.58
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Asic4Q7TNS7 539 aa31.14■■■□□ 2.58
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa31.14■■■□□ 2.58
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Nkx2-3P97334 362 aa31.13■■■□□ 2.57
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Chmp7Q8R1T1 451 aa31.13■■■□□ 2.57
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ankrd50F7BE84 1390 aa31.11■■■□□ 2.57
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa31.11■■■□□ 2.57
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa31.09■■■□□ 2.57
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gm7361D3Z6R1 267 aa31.09■■■□□ 2.57
Lmo4-201ENSMUST00000120539 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa31.09■■■□□ 2.57
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gm1979E9QAN3 267 aa31.09■■■□□ 2.57
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gm5862K7N5V5 267 aa31.09■■■□□ 2.57
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gm10220K7N660 267 aa31.09■■■□□ 2.57
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gas2l2Q5SSG4 860 aa31.09■■■□□ 2.57
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Prim1P20664 417 aa31.09■■■□□ 2.57
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Slc5a1Q8C3K6 665 aa31.09■■■□□ 2.57
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Anks4bQ8K3X6 423 aa31.09■■■□□ 2.57
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gnai1B2RSH2 354 aa31.08■■■□□ 2.57
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ggnbp2Q5SV77 696 aa31.08■■■□□ 2.57
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa31.08■■■□□ 2.57
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gnai3Q9DC51 354 aa31.08■■■□□ 2.57
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Klhdc4Q921I2 584 aa31.05■■■□□ 2.56
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ly75Q60767 1723 aa31.03■■■□□ 2.56
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Taok3Q8BYC6 898 aa31.03■■■□□ 2.56
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
Lmo4-201ENSMUST00000120539 4930523C07RikE9Q2T4 99 aa31.02■■■□□ 2.56
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ksr2Q3UVC0 959 aa31.02■■■□□ 2.56
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ccdc155Q80VJ8 648 aa31.01■■■□□ 2.55
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Crb1Q8VHS2 1405 aa30.99■■■□□ 2.55
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
Lmo4-201ENSMUST00000120539 GakQ99KY4 1305 aa30.98■■■□□ 2.55
Lmo4-201ENSMUST00000120539 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ints5Q8CHT3 1018 aa30.98■■■□□ 2.55
Lmo4-201ENSMUST00000120539 ApobrQ8VBT6 942 aa30.97■■■□□ 2.55
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Usp16Q99LG0 825 aa30.97■■■□□ 2.55
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Btbd11Q6GQW0 1109 aa30.96■■■□□ 2.55
Lmo4-201ENSMUST00000120539 NudcO35685 332 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Plekhh1Q80TI1 1356 aa30.94■■■□□ 2.54
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Shank3Q4ACU6 1730 aa30.93■■■□□ 2.54
Lmo4-201ENSMUST00000120539 CastP51125 788 aa30.93■■■□□ 2.54
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Abca3Q8R420 1704 aa30.91■■■□□ 2.54
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Igsf1Q7TQA1 1317 aa30.91■■■□□ 2.54
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Pibf1E9Q6K3 756 aa30.9■■■□□ 2.54
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ttc41Q692V3 1318 aa30.9■■■□□ 2.54
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Dlg5E9Q9R9 1921 aa30.9■■■□□ 2.54
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Kank1E9Q238 1360 aa30.89■■■□□ 2.54
Lmo4-201ENSMUST00000120539 L3mbtl2P59178 703 aa30.89■■■□□ 2.54
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa30.89■■■□□ 2.54
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Pnpla7A2AJ88 1352 aa30.89■■■□□ 2.54
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Bsdc1Q80Y55 427 aa30.88■■■□□ 2.53
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Erbb3Q61526 1339 aa30.87■■■□□ 2.53
Lmo4-201ENSMUST00000120539 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa30.87■■■□□ 2.53
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Col1a2Q01149 1372 aa30.87■■■□□ 2.53
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Eif4a1P60843 406 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa30.86■■■□□ 2.53
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Zcrb1Q9CZ96 217 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cyp2d12Q8BVD2 504 aa30.85■■■□□ 2.53
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Lrit1Q8K099 624 aa30.84■■■□□ 2.53
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Trim26Q99PN3 545 aa30.84■■■□□ 2.53
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Msh6P54276 1358 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
Lmo4-201ENSMUST00000120539 AceP09470 1312 aa30.84■■■□□ 2.53
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Sugp2Q8CH09 1067 aa30.84■■■□□ 2.53
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ppfibp2O35711 882 aa30.83■■■□□ 2.53
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Efcab2Q9CQ46 164 aa30.83■■■□□ 2.53
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa30.83■■■□□ 2.53
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Vamp4O70480 141 aa30.82■■■□□ 2.52
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa30.81■■■□□ 2.52
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Chpf2Q3UU43 768 aa30.8■■■□□ 2.52
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Irx6Q9ER75 438 aa30.8■■■□□ 2.52
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ubap1lG3UW59 384 aa30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.7 ms