RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101336.9

Cited1-202, Transcript of Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cited1, Length 1,090 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1-202ENSMUST00000101336 Shank3Q4ACU6 1730 aa30,05■■■□□ 2,4
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Cited1-202ENSMUST00000101336 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP29,8■■■□□ 2,36
Cited1-202ENSMUST00000101336 Crb1Q8VHS2 1405 aa29,79■■■□□ 2,36
Cited1-202ENSMUST00000101336 Sumf1Q8R0F3 372 aa29,79■■■□□ 2,36
Cited1-202ENSMUST00000101336 Rnaseh2aQ9CWY8 301 aa29,78■■■□□ 2,36
Cited1-202ENSMUST00000101336 Sned1Q70E20 1403 aa29,77■■■□□ 2,36
Cited1-202ENSMUST00000101336 Tns2Q8CGB6 1400 aa29,76■■■□□ 2,35
Cited1-202ENSMUST00000101336 Smarcc1P97496 1104 aa29,75■■■□□ 2,35
Cited1-202ENSMUST00000101336 Inpp5dQ9ES52 1191 aa29,75■■■□□ 2,35
Cited1-202ENSMUST00000101336 Fam122aQ9DB52 284 aa29,74■■■□□ 2,35
Cited1-202ENSMUST00000101336 Spata31d1bE9QA57 1361 aa29,74■■■□□ 2,35
Cited1-202ENSMUST00000101336 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa29,73■■■□□ 2,35
Cited1-202ENSMUST00000101336 Gm13023A2A8N2 498 aa29,72■■■□□ 2,35
Cited1-202ENSMUST00000101336 Jmjd4Q8BFT6 427 aa29,72■■■□□ 2,35
Cited1-202ENSMUST00000101336 Phkg2Q9DB30 406 aa29,72■■■□□ 2,35
Cited1-202ENSMUST00000101336 Asic4Q7TNS7 539 aa29,71■■■□□ 2,35
Cited1-202ENSMUST00000101336 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP29,71■■■□□ 2,35
Cited1-202ENSMUST00000101336 MpripP97434 1024 aa29,7■■■□□ 2,35
Cited1-202ENSMUST00000101336 Zdbf2Q5SS00 2493 aaKnown RBP29,7■■■□□ 2,34
Cited1-202ENSMUST00000101336 Chmp7Q8R1T1 451 aa29,68■■■□□ 2,34
Cited1-202ENSMUST00000101336 SnrkQ8VDU5 748 aa29,68■■■□□ 2,34
Cited1-202ENSMUST00000101336 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa29,67■■■□□ 2,34
Cited1-202ENSMUST00000101336 Msh6P54276 1358 aaKnown RBP29,66■■■□□ 2,34
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Cited1-202ENSMUST00000101336 Atg3Q9CPX6 314 aa29,66■■■□□ 2,34
Cited1-202ENSMUST00000101336 Plch1Q4KWH5 1682 aa29,66■■■□□ 2,34
Cited1-202ENSMUST00000101336 Ints5Q8CHT3 1018 aa29,65■■■□□ 2,34
Cited1-202ENSMUST00000101336 Ssfa2Q922B9 1252 aa29,65■■■□□ 2,34
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Cited1-202ENSMUST00000101336 Trim28Q62318 834 aa29,63■■■□□ 2,33
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Cited1-202ENSMUST00000101336 Pdzd9Q9D9M4 266 aa29,63■■■□□ 2,33
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Cited1-202ENSMUST00000101336 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa29,62■■■□□ 2,33
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Cited1-202ENSMUST00000101336 Cyp2c69E9PXC3 491 aa29,6■■■□□ 2,33
Cited1-202ENSMUST00000101336 Cyp2c40P56657 491 aa29,6■■■□□ 2,33
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Cited1-202ENSMUST00000101336 Col11a2Q64739 1736 aa29,59■■■□□ 2,33
Cited1-202ENSMUST00000101336 Zscan10Q3URR7 782 aa29,58■■■□□ 2,33
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Cited1-202ENSMUST00000101336 Amotl1Q9D4H4 968 aa29,53■■■□□ 2,32
Cited1-202ENSMUST00000101336 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP29,52■■■□□ 2,32
Cited1-202ENSMUST00000101336 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP29,52■■■□□ 2,32
Cited1-202ENSMUST00000101336 FktnQ8R507 461 aa29,52■■■□□ 2,32
Cited1-202ENSMUST00000101336 Ric1Q69ZJ7 1422 aa29,5■■■□□ 2,31
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