RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101336.9

Cited1-202, Transcript of Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cited1, Length 1,090 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited1-202ENSMUST00000101336 Trim41Q5NCC3 630 aa41,24■■■■■ 4,19
Cited1-202ENSMUST00000101336 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa41,02■■■■■ 4,16
Cited1-202ENSMUST00000101336 CftrP26361 1476 aa41,01■■■■■ 4,16
Cited1-202ENSMUST00000101336 Synj1Q8CHC4 1574 aa40,83■■■■■ 4,13
Cited1-202ENSMUST00000101336 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa40,75■■■■■ 4,11
Cited1-202ENSMUST00000101336 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP40,71■■■■■ 4,11
Cited1-202ENSMUST00000101336 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP40,59■■■■■ 4,09
Cited1-202ENSMUST00000101336 Rtl1Q7M732 1744 aa40,58■■■■■ 4,09
Cited1-202ENSMUST00000101336 Cux2P70298 1426 aa40,52■■■■■ 4,08
Cited1-202ENSMUST00000101336 Kif21aQ9QXL2 1672 aa40,4■■■■■ 4,06
Cited1-202ENSMUST00000101336 Kif15Q6P9L6 1387 aa40,38■■■■■ 4,06
Cited1-202ENSMUST00000101336 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP40,36■■■■■ 4,05
Cited1-202ENSMUST00000101336 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa40,28■■■■■ 4,04
Cited1-202ENSMUST00000101336 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP40,17■■■■■ 4,02
Cited1-202ENSMUST00000101336 Shroom2A2ALU4 1481 aa40,15■■■■■ 4,02
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Cited1-202ENSMUST00000101336 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP38,67■■■■□ 3,78
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Cited1-202ENSMUST00000101336 CadpsQ80TJ1 1355 aa37,97■■■■□ 3,67
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