RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000077257.11

Rxra-201, Transcript of Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rxra, Length 4,905 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rxra-201ENSMUST00000077257 Sik1Q60670 779 aa22.09■■□□□ 1.13
Rxra-201ENSMUST00000077257 Trim44Q9QXA7 346 aa22.09■■□□□ 1.13
Rxra-201ENSMUST00000077257 PrxO55103 1391 aa22.09■■□□□ 1.13
Rxra-201ENSMUST00000077257 Nphp1Q9QY53 687 aa22.08■■□□□ 1.13
Rxra-201ENSMUST00000077257 Olfr247E9PVJ7 320 aa22.08■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Olfr819K7N727 320 aa22.08■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ppfibp2O35711 882 aa22.08■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Trim29Q8R2Q0 587 aa22.08■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ces1aE9PYP1 563 aa22.08■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Gm973E9Q295 1059 aa22.08■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Znf710Q3U288 666 aa22.08■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Polr3aB2RXC6 1390 aa22.07■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Riok1Q922Q2 567 aa22.07■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 RarsQ9D0I9 660 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 NinlQ6ZQ12 1394 aa22.06■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Pank1Q8K4K6 548 aa22.06■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Card10P58660 1021 aa22.06■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Klhdc4Q921I2 584 aa22.06■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa22.05■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Chpf2Q3UU43 768 aa22.05■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ccdc96Q9CR92 584 aa22.05■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Cwc25Q9DBF7 416 aa22.05■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa22.05■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Vps37dQ810I0 261 aa22.04■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Yeats2Q3TUF7 1407 aa22.04■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Eif6O55135 245 aa22.04■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Irf9Q61179 399 aa22.04■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Cep131Q62036 1060 aa22.03■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Dpp7Q9ET22 506 aa22.03■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Plekho1Q9JIY0 408 aa22.03■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Znf287Q9EQB9 759 aa22.03■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Cfap74Q3UY96 1578 aa22.03■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Dnajc2P54103 621 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Igflr1Q3U4N7 345 aa22.03■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 March6Q6ZQ89 909 aa22.03■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Atp10aO54827 1508 aa22.02■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ncf1Q09014 390 aa22.02■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Amotl1Q9D4H4 968 aa22.02■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ssh2Q5SW75 1423 aa22.02■■□□□ 1.12
Rxra-201ENSMUST00000077257 Rfx7F8VPJ6 1459 aa22.02■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 PaskQ8CEE6 1383 aa22.02■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 Tmc1Q8R4P5 757 aa22.02■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 Smim5Q8BT42 78 aa22.01■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 Filip1lQ6P6L0 1131 aa22.01■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 Srgap3Q812A2 1099 aa22.01■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ankrd26Q811D2 1581 aa22.01■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 Bsdc1Q80Y55 427 aa22.01■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 Prdm11A2AGX3 565 aa22■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 Skap1Q3UUV5 355 aa21.99■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 Nup133Q8R0G9 1155 aa21.99■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 Plekhg2Q6KAU7 1340 aa21.99■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 Taok2Q6ZQ29 1240 aa21.99■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 Tnni2P13412 182 aa21.99■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 Atp6v1aP50516 617 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 Sh3tc1G3X9F6 1346 aa21.99■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 Pet2A2AHY8 747 aa21.99■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 Phactr2B1AVP0 632 aa21.99■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 FosbP13346 338 aa21.98■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 Speer4dL7N216 212 aa21.98■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 Asxl1P59598 1514 aa21.98■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 Sos1Q62245 1319 aa21.98■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 Izumo3A6PWV3 263 aa21.98■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 Galntl5Q9D4M9 431 aa21.98■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 Epb41l3Q9WV92 929 aa21.97■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 Esco1Q69Z69 843 aa21.97■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 Tmem143Q8VD26 458 aa21.96■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 Gtf2f1Q3THK3 508 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
Rxra-201ENSMUST00000077257 Gnat3Q3V3I2 354 aa21.95■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Cfap65Q3V0B4 1847 aa21.95■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ipo8Q7TMY7 1010 aa21.95■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ift74Q8BKE9 600 aa21.94■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Rhot2Q8JZN7 620 aa21.94■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Zkscan2G3X952 960 aa21.94■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa21.94■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Znf608Q56A10 1511 aa21.94■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa21.94■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Arid3aQ62431 601 aa21.94■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Map3k2Q61083 619 aa21.93■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ankrd23Q812A3 306 aa21.92■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Krt84Q99M73 603 aa21.92■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Mrpl12Q9DB15 201 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Hoxc9P09633 260 aa21.92■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Mum1Q6DID5 682 aa21.92■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Foxo3Q9WVH4 672 aa21.92■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Astn2Q80Z10 1352 aa21.92■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Slc26a8Q8R0C3 999 aa21.92■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ltv1Q6NSQ7 470 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Rbm17Q8JZX4 405 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Stk32bQ9JJX8 414 aa21.91■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Wdr78E9PYY5 807 aa21.91■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 St18Q80TY4 1045 aa21.91■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Eif4a2P10630 407 aa21.9■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Nlgn1Q99K10 843 aa21.9■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Taf7Q9R1C0 341 aa21.9■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Chmp4cQ9D7F7 232 aa21.9■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Palm3A2TJV2 734 aa21.9■■□□□ 1.1
Rxra-201ENSMUST00000077257 Tut1Q8R3F9 869 aa21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.2 ms