RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa29.06■■■□□ 2.24
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Magea5O89009 320 aa29.05■■■□□ 2.24
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gpr150Q8BL07 427 aa29.05■■■□□ 2.24
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Magea2Q9R2A2 320 aa29.05■■■□□ 2.24
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Eya1P97767 591 aa29.04■■■□□ 2.24
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zscan21Q07231 555 aa29.04■■■□□ 2.24
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kcnq2Q9Z351 759 aa28.87■■■□□ 2.21
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tns2Q8CGB6 1400 aa28.86■■■□□ 2.21
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Stk31Q99MW1 1018 aa28.85■■■□□ 2.21
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Crb1Q8VHS2 1405 aa28.78■■■□□ 2.2
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Igsf1Q7TQA1 1317 aa28.78■■■□□ 2.2
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Q4VA45 678 aa28.77■■■□□ 2.2
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Emilin1Q99K41 1017 aa28.77■■■□□ 2.2
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Znf541Q0GGX2 1363 aa28.76■■■□□ 2.2
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Asic4Q7TNS7 539 aa28.76■■■□□ 2.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Amotl1Q9D4H4 968 aa28.76■■■□□ 2.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Phkg2Q9DB30 406 aa28.76■■■□□ 2.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 MeiocA2AG06 965 aa28.73■■■□□ 2.19
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pdzd9Q9D9M4 266 aa28.71■■■□□ 2.19
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Msl1Q6PDM1 616 aa28.68■■■□□ 2.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Chmp7Q8R1T1 451 aa28.68■■■□□ 2.18
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rad23bP54728 416 aa28.62■■■□□ 2.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mtfr1lQ9CWE0 289 aa28.62■■■□□ 2.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Swt1Q9DBQ9 907 aa28.62■■■□□ 2.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Aox2Q5SGK3 1345 aa28.62■■■□□ 2.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lrp5Q91VN0 1614 aa28.61■■■□□ 2.17
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Jmjd4Q8BFT6 427 aa28.6■■■□□ 2.17
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