RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa25.87■■□□□ 1.73
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gnai3Q9DC51 354 aa25.87■■□□□ 1.73
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SkilQ60665 675 aa25.86■■□□□ 1.73
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gimap6Q8K349 305 aa25.86■■□□□ 1.73
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Wdr17E9Q271 1322 aa25.85■■□□□ 1.73
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ano8Q6PB70 1060 aa25.85■■□□□ 1.73
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kif2cQ922S8 721 aa25.85■■□□□ 1.73
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Robo1O89026 1612 aa25.84■■□□□ 1.73
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mcm4P49717 862 aa25.83■■□□□ 1.73
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kcnn1Q9EQR3 537 aa25.83■■□□□ 1.73
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm10093D3YYI8 482 aa25.83■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ncoa4Q5U4H9 625 aa25.83■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nyap1Q6PFX7 833 aa25.83■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cetn4Q8K4K1 168 aa25.83■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TimelessQ9R1X4 1197 aa25.83■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hoxc9P09633 260 aa25.82■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccdc60Q8C4J0 545 aa25.82■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Siglec1Q62230 1695 aa25.81■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kif18aQ91WD7 886 aa25.81■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Catsper2A2ARP9 588 aa25.81■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atf3Q60765 181 aa25.81■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Armcx1Q9CX83 456 aa25.81■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nfat5Q9WV30 1534 aa25.8■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Eya1P97767 591 aa25.79■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rrp9Q91WM3 475 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sos1Q62245 1319 aa25.78■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trpm3Q5F4S9 1721 aa25.78■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccne1Q61457 408 aa25.78■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kcna6Q61923 529 aa25.78■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AU019823E9PUQ3 292 aa25.77■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fbln2P37889 1221 aa25.77■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa25.77■■□□□ 1.72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Farp2Q91VS8 1065 aa25.76■■□□□ 1.71
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa25.76■■□□□ 1.71
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kcnh5Q920E3 988 aa25.76■■□□□ 1.71
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pnmal2G3X9N3 661 aa25.75■■□□□ 1.71
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ssh1Q76I79 1042 aa25.74■■□□□ 1.71
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TatQ8QZR1 454 aa25.74■■□□□ 1.71
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kdm4cQ8VCD7 1054 aa25.74■■□□□ 1.71
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Arfgef2A2A5R2 1792 aa25.73■■□□□ 1.71
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Qtrt2B8ZXI1 415 aa25.73■■□□□ 1.71
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rsph3aQ3UFY4 516 aa25.73■■□□□ 1.71
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem132eQ6IEE6 982 aa25.73■■□□□ 1.71
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cluap1Q8R3P7 413 aa25.73■■□□□ 1.71
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa25.73■■□□□ 1.71
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 LifrP42703 1092 aa25.72■■□□□ 1.71
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Usp16Q99LG0 825 aa25.72■■□□□ 1.71
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vamp4O70480 141 aa25.7■■□□□ 1.71
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.71
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa25.7■■□□□ 1.71
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fmnl2A2APV2 1086 aa25.69■■□□□ 1.7
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kdm6aO70546 1401 aa25.69■■□□□ 1.7
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nsd3Q6P2L6 1439 aa25.68■■□□□ 1.7
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cavin2Q63918 418 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cgnl1Q6AW69 1298 aa25.68■■□□□ 1.7
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cypt2Q6P924 180 aa25.68■■□□□ 1.7
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 HypkQ9CR41 129 aa25.68■■□□□ 1.7
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tet3Q8BG87 1668 aa25.67■■□□□ 1.7
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp142G5E869 1843 aa25.67■■□□□ 1.7
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 GnpatP98192 678 aa25.67■■□□□ 1.7
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa25.67■■□□□ 1.7
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MvpQ9EQK5 861 aa25.67■■□□□ 1.7
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cog6Q8R3I3 657 aa25.66■■□□□ 1.7
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa25.66■■□□□ 1.7
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ddit3P35639 168 aa25.64■■□□□ 1.7
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Klhdc4Q921I2 584 aa25.64■■□□□ 1.7
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ankrd44B2RXR6 993 aa25.64■■□□□ 1.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 ArxO35085 564 aa25.64■■□□□ 1.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dnajc10Q9DC23 793 aa25.64■■□□□ 1.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Wdr63B2RY71 923 aa25.63■■□□□ 1.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmco5bQ80X59 307 aa25.63■■□□□ 1.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dzip1Q8BMD2 852 aa25.63■■□□□ 1.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cypt1Q8CH20 168 aa25.63■■□□□ 1.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TnrQ8BYI9 1358 aa25.63■■□□□ 1.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q3UPC7 1272 aa25.62■■□□□ 1.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa25.62■■□□□ 1.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znf330Q922H9 316 aa25.61■■□□□ 1.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sema6bO54951 886 aa25.6■■□□□ 1.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nectin2P32507 530 aa25.6■■□□□ 1.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1700010I14RikQ7TPG0 532 aa25.6■■□□□ 1.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Anapc15-psA0A140T8L6 141 aa25.58■■□□□ 1.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ggnbp2Q5SV77 696 aa25.58■■□□□ 1.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Aldh8a1Q8BH00 487 aa25.58■■□□□ 1.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa25.58■■□□□ 1.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kif24Q6NWW5 1356 aa25.57■■□□□ 1.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dixdc1Q80Y83 711 aa25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42.1 ms