RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027809.7

Opn3-201, Transcript of Opsin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Opn3, Length 1,913 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3-201ENSMUST00000027809 Prim1P20664 417 aa28.21■■■□□ 2.11
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Ttll13A4Q9F6 804 aa28.19■■■□□ 2.1
Opn3-201ENSMUST00000027809 CenpbP27790 599 aa28.19■■■□□ 2.1
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gm10471E9Q1C7 252 aa28.18■■■□□ 2.1
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa28.15■■■□□ 2.1
Opn3-201ENSMUST00000027809 Supt16hQ920B9 1047 aa28.15■■■□□ 2.1
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Chl1P70232 1209 aa28.12■■■□□ 2.09
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Pibf1E9Q6K3 756 aa28.06■■■□□ 2.08
Opn3-201ENSMUST00000027809 Znf330Q922H9 316 aa28.06■■■□□ 2.08
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
Opn3-201ENSMUST00000027809 Acsbg1Q99PU5 721 aa28.04■■■□□ 2.08
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Opn3-201ENSMUST00000027809 MvpQ9EQK5 861 aa28.02■■■□□ 2.08
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rlbp1Q9Z275 317 aa28.02■■■□□ 2.08
Opn3-201ENSMUST00000027809 Pdzd9Q9D9M4 266 aa28.01■■■□□ 2.07
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Cyp2d12Q8BVD2 504 aa28■■■□□ 2.07
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Opn3-201ENSMUST00000027809 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa27.99■■■□□ 2.07
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Aifm3Q3TY86 605 aa27.92■■■□□ 2.06
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Cnksr1A2A9K7 700 aa27.88■■■□□ 2.05
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Tmem119Q8R138 280 aa27.84■■■□□ 2.05
Opn3-201ENSMUST00000027809 Atl3Q91YH5 541 aa27.83■■■□□ 2.05
Opn3-201ENSMUST00000027809 Speer4bQ9D9F7 267 aa27.83■■■□□ 2.05
Opn3-201ENSMUST00000027809 CoilQ5SU73 570 aa27.82■■■□□ 2.04
Opn3-201ENSMUST00000027809 B4galnt3Q6L8S8 986 aa27.82■■■□□ 2.04
Opn3-201ENSMUST00000027809 Zeb2Q9R0G7 1215 aa27.82■■■□□ 2.04
Opn3-201ENSMUST00000027809 Qtrt2B8ZXI1 415 aa27.82■■■□□ 2.04
Opn3-201ENSMUST00000027809 Disp3A3KFU9 1347 aa27.81■■■□□ 2.04
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
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