RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027777.11

Parp1-201, Transcript of Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Parp1, Length 3,873 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1-201ENSMUST00000027777 Gm29106A0A087WSP8 697 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Ssxb6A2BI74 170 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Ccnb1ip1D3Z3K2 276 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Rpl3lE9PWZ3 407 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Hsd17b14E9Q3D4 273 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Gm17555F6U8B9 371 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Zfp715G3X9T1 886 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Vmn2r31L7N1Z4 861 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Prom1O54990 867 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Mtnd1P03888 318 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Srp54P14576 504 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Cma1P21844 247 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Ccnd3P30282 292 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 DckP43346 260 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 St14P56677 855 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Polr2iP60898 125 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Ctps2P70303 586 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Abhd15Q5F2F2 459 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Kcna5Q61762 602 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 SowahaQ8BLS7 548 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Ckap4Q8BMK4 575 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Phf11aQ8BVM9 293 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Fmo2Q8K2I3 535 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Ugt2b1Q8R084 529 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Hip1Q8VD75 1029 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Ndufs2Q91WD5 463 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Cd209eQ91ZW7 208 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Themis3Q9CU24 569 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Psmd8Q9CX56 353 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Hacd2Q9D3B1 254 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Cnbd2Q9D5U8 673 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Rpap3Q9D706 660 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Spock2Q9ER58 423 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Ngly1Q9JI78 651 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Pkp3Q9QY23 797 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Arih2Q9Z1K6 492 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 HnrnpfQ9Z2X1 415 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 SisF8VQM5 1818 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Robo3Q9Z2I4 1366 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 F6Y6L6 278 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Gm16506F7ANP4 213 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Capn5O08688 640 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 NmbrO54799 390 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Cd4P06332 457 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Htr2cP34968 459 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Serpind1P49182 478 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Hnf4aP49698 474 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Mc4rP56450 332 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Kcnab2P62482 367 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Vps45P97390 570 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Tarbp2P97473 365 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Adra1dP97714 562 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 SobpQ0P5V2 864 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Trappc9Q3U0M1 1148 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Zfp78Q5U406 512 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Plekha6Q7TQG1 1173 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Olfr698Q7TRN4 311 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Chst2Q80WV3 530 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Lair1Q8BG84 263 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 MaobQ8BW75 520 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Fndc3aQ8BX90 1198 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Celf3Q8CIN6 465 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Ero1bQ8R2E9 467 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Actr8Q8R2S9 624 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Olfr570Q8VH12 312 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Pcdhb21Q91V48 774 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Chil4Q91Z98 402 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Ctu1Q99J10 420 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Riok2Q9CQS5 547 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Gadd45gip1Q9CR59 222 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Tubb3Q9ERD7 450 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Cpsf3Q9QXK7 684 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Spo11Q9WTK8 396 aa9.98□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Olfr1215A3KGY3 312 aa9.97□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Kbtbd6E9PYD7 486 aa9.97□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Gm10722F6VLK5 217 aa9.97□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Kbtbd7G5E8C2 690 aa9.97□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 PolP11369 1281 aa9.97□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Atp6v1e1P50518 226 aa9.97□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 NfycP70353 335 aa9.97□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Rit1P70426 219 aa9.97□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Pecam1Q08481 727 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Fam47cQ14BE7 430 aa9.97□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 AcdQ5EE38 416 aa9.97□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Eps15l1Q60902 907 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Adgre1Q61549 931 aa9.97□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Ifngr2Q63953 332 aa9.97□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Rasa4Q6PFQ7 802 aa9.97□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Olfr1252Q7TQZ2 314 aa9.97□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Pcsk9Q80W65 694 aa9.97□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Wscd1Q80XH4 572 aa9.97□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Cadm2Q8BLQ9 435 aa9.97□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Fam155aQ8CCS2 467 aa9.97□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Nckap1lQ8K1X4 1134 aa9.97□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 St7lQ8K4P7 559 aa9.97□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Rtfdc1Q99K95 307 aa9.97□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 LiasQ99M04 373 aa9.97□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Rnf111Q99ML9 989 aa9.97□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Ppp6cQ9CQR6 305 aa9.97□□□□□ -0.81
Parp1-201ENSMUST00000027777 Sertad3Q9ERC3 197 aa9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.2 ms