Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rpl3lE9PWZ3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Rpl3lE9PWZ3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rpl3lE9PWZ3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rpl3lE9PWZ3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rpl3lE9PWZ3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Rpl3lE9PWZ3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rpl3lE9PWZ3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rpl3lE9PWZ3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rpl3lE9PWZ3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rpl3lE9PWZ3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rpl3lE9PWZ3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rpl3lE9PWZ3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rpl3lE9PWZ3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpl3lE9PWZ3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpl3lE9PWZ3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpl3lE9PWZ3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpl3lE9PWZ3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rpl3lE9PWZ3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rpl3lE9PWZ3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rpl3lE9PWZ3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Rpl3lE9PWZ3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Rpl3lE9PWZ3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpl3lE9PWZ3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpl3lE9PWZ3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rpl3lE9PWZ3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rpl3lE9PWZ3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rpl3lE9PWZ3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpl3lE9PWZ3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Rpl3lE9PWZ3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rpl3lE9PWZ3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rpl3lE9PWZ3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rpl3lE9PWZ3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpl3lE9PWZ3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpl3lE9PWZ3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpl3lE9PWZ3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpl3lE9PWZ3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rpl3lE9PWZ3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rpl3lE9PWZ3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpl3lE9PWZ3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rpl3lE9PWZ3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Rpl3lE9PWZ3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rpl3lE9PWZ3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Rpl3lE9PWZ3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rpl3lE9PWZ3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rpl3lE9PWZ3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rpl3lE9PWZ3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rpl3lE9PWZ3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rpl3lE9PWZ3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rpl3lE9PWZ3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Rpl3lE9PWZ3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rpl3lE9PWZ3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rpl3lE9PWZ3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rpl3lE9PWZ3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpl3lE9PWZ3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rpl3lE9PWZ3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rpl3lE9PWZ3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rpl3lE9PWZ3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rpl3lE9PWZ3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rpl3lE9PWZ3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rpl3lE9PWZ3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rpl3lE9PWZ3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpl3lE9PWZ3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpl3lE9PWZ3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpl3lE9PWZ3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rpl3lE9PWZ3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rpl3lE9PWZ3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpl3lE9PWZ3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rpl3lE9PWZ3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rpl3lE9PWZ3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpl3lE9PWZ3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpl3lE9PWZ3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpl3lE9PWZ3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpl3lE9PWZ3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Rpl3lE9PWZ3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpl3lE9PWZ3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpl3lE9PWZ3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpl3lE9PWZ3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpl3lE9PWZ3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpl3lE9PWZ3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpl3lE9PWZ3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpl3lE9PWZ3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpl3lE9PWZ3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpl3lE9PWZ3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rpl3lE9PWZ3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpl3lE9PWZ3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpl3lE9PWZ3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpl3lE9PWZ3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpl3lE9PWZ3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpl3lE9PWZ3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpl3lE9PWZ3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpl3lE9PWZ3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpl3lE9PWZ3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpl3lE9PWZ3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpl3lE9PWZ3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rpl3lE9PWZ3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpl3lE9PWZ3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpl3lE9PWZ3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpl3lE9PWZ3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpl3lE9PWZ3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.7 ms