Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45,62■■■■■ 4,89
Ccnd3P30282 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42,38■■■■■ 4,37
Ccnd3P30282 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,68■■■■■ 4,26
Ccnd3P30282 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39,72■■■■□ 3,95
Ccnd3P30282 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39,46■■■■□ 3,91
Ccnd3P30282 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38,55■■■■□ 3,76
Ccnd3P30282 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,52■■■■□ 3,76
Ccnd3P30282 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,41■■■■□ 3,74
Ccnd3P30282 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38,34■■■■□ 3,73
Ccnd3P30282 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38■■■■□ 3,67
Ccnd3P30282 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,99■■■■□ 3,67
Ccnd3P30282 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37,22■■■■□ 3,55
Ccnd3P30282 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,11■■■■□ 3,53
Ccnd3P30282 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36,9■■■■□ 3,5
Ccnd3P30282 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,87■■■■□ 3,49
Ccnd3P30282 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,82■■■■□ 3,48
Ccnd3P30282 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
Ccnd3P30282 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,69■■■■□ 3,46
Ccnd3P30282 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36,49■■■■□ 3,43
Ccnd3P30282 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,48■■■■□ 3,43
Ccnd3P30282 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,3■■■■□ 3,4
Ccnd3P30282 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36,16■■■■□ 3,38
Ccnd3P30282 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,14■■■■□ 3,38
Ccnd3P30282 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36,1■■■■□ 3,37
Ccnd3P30282 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
Ccnd3P30282 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,92■■■■□ 3,34
Ccnd3P30282 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Ccnd3P30282 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35,64■■■■□ 3,3
Ccnd3P30282 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Ccnd3P30282 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Ccnd3P30282 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Ccnd3P30282 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,34■■■■□ 3,25
Ccnd3P30282 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,33■■■■□ 3,25
Ccnd3P30282 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35,22■■■■□ 3,23
Ccnd3P30282 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35■■■■□ 3,19
Ccnd3P30282 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3,19
Ccnd3P30282 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34,96■■■■□ 3,19
Ccnd3P30282 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34,86■■■■□ 3,17
Ccnd3P30282 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Ccnd3P30282 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34,77■■■■□ 3,16
Ccnd3P30282 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,66■■■■□ 3,14
Ccnd3P30282 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34,57■■■■□ 3,12
Ccnd3P30282 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Ccnd3P30282 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34,5■■■■□ 3,11
Ccnd3P30282 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Ccnd3P30282 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Ccnd3P30282 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Ccnd3P30282 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34,21■■■■□ 3,07
Ccnd3P30282 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,17■■■■□ 3,06
Ccnd3P30282 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34,17■■■■□ 3,06
Ccnd3P30282 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34,17■■■■□ 3,06
Ccnd3P30282 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34,12■■■■□ 3,05
Ccnd3P30282 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34,07■■■■□ 3,04
Ccnd3P30282 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34,06■■■■□ 3,04
Ccnd3P30282 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,92■■■■□ 3,02
Ccnd3P30282 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Ccnd3P30282 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Ccnd3P30282 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33,9■■■■□ 3,02
Ccnd3P30282 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33,88■■■■□ 3,01
Ccnd3P30282 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Ccnd3P30282 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Ccnd3P30282 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Ccnd3P30282 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Ccnd3P30282 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33,77■■■■□ 3
Ccnd3P30282 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33,76■■■□□ 2,99
Ccnd3P30282 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33,74■■■□□ 2,99
Ccnd3P30282 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33,49■■■□□ 2,95
Ccnd3P30282 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Ccnd3P30282 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33,43■■■□□ 2,94
Ccnd3P30282 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33,41■■■□□ 2,94
Ccnd3P30282 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Ccnd3P30282 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Ccnd3P30282 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33,36■■■□□ 2,93
Ccnd3P30282 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Ccnd3P30282 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Ccnd3P30282 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Ccnd3P30282 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Ccnd3P30282 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,2■■■□□ 2,91
Ccnd3P30282 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Ccnd3P30282 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Ccnd3P30282 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Ccnd3P30282 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Ccnd3P30282 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33,01■■■□□ 2,87
Ccnd3P30282 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32,98■■■□□ 2,87
Ccnd3P30282 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32,95■■■□□ 2,87
Ccnd3P30282 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Ccnd3P30282 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32,84■■■□□ 2,85
Ccnd3P30282 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32,83■■■□□ 2,85
Ccnd3P30282 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Ccnd3P30282 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Ccnd3P30282 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
Ccnd3P30282 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32,79■■■□□ 2,84
Ccnd3P30282 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,78■■■□□ 2,84
Ccnd3P30282 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32,74■■■□□ 2,83
Ccnd3P30282 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,73■■■□□ 2,83
Ccnd3P30282 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Ccnd3P30282 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32,67■■■□□ 2,82
Ccnd3P30282 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Ccnd3P30282 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32,65■■■□□ 2,82
Ccnd3P30282 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,2 ms