Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45.62■■■■■ 4.89
Ccnd3P30282 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
Ccnd3P30282 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Ccnd3P30282 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
Ccnd3P30282 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
Ccnd3P30282 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
Ccnd3P30282 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Ccnd3P30282 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Ccnd3P30282 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Ccnd3P30282 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38■■■■□ 3.67
Ccnd3P30282 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Ccnd3P30282 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Ccnd3P30282 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Ccnd3P30282 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ccnd3P30282 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ccnd3P30282 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Ccnd3P30282 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ccnd3P30282 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ccnd3P30282 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ccnd3P30282 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ccnd3P30282 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ccnd3P30282 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Ccnd3P30282 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ccnd3P30282 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ccnd3P30282 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ccnd3P30282 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ccnd3P30282 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ccnd3P30282 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Ccnd3P30282 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ccnd3P30282 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ccnd3P30282 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ccnd3P30282 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ccnd3P30282 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ccnd3P30282 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ccnd3P30282 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Ccnd3P30282 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
Ccnd3P30282 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ccnd3P30282 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ccnd3P30282 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ccnd3P30282 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Ccnd3P30282 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ccnd3P30282 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ccnd3P30282 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ccnd3P30282 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccnd3P30282 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ccnd3P30282 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ccnd3P30282 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ccnd3P30282 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Ccnd3P30282 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ccnd3P30282 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ccnd3P30282 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ccnd3P30282 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccnd3P30282 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ccnd3P30282 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Ccnd3P30282 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccnd3P30282 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccnd3P30282 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccnd3P30282 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccnd3P30282 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccnd3P30282 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ccnd3P30282 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ccnd3P30282 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ccnd3P30282 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ccnd3P30282 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Ccnd3P30282 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ccnd3P30282 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccnd3P30282 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccnd3P30282 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccnd3P30282 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccnd3P30282 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccnd3P30282 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccnd3P30282 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccnd3P30282 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccnd3P30282 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ccnd3P30282 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ccnd3P30282 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ccnd3P30282 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ccnd3P30282 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ccnd3P30282 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccnd3P30282 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccnd3P30282 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ccnd3P30282 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccnd3P30282 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Ccnd3P30282 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ccnd3P30282 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ccnd3P30282 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ccnd3P30282 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ccnd3P30282 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ccnd3P30282 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccnd3P30282 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccnd3P30282 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccnd3P30282 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccnd3P30282 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccnd3P30282 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccnd3P30282 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccnd3P30282 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccnd3P30282 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccnd3P30282 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccnd3P30282 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccnd3P30282 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms