Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW7

Cd209e, CD209 antigen-like protein E, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd209eQ91ZW7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Cd209eQ91ZW7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cd209eQ91ZW7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cd209eQ91ZW7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Cd209eQ91ZW7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Cd209eQ91ZW7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Cd209eQ91ZW7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Cd209eQ91ZW7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cd209eQ91ZW7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Cd209eQ91ZW7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cd209eQ91ZW7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Cd209eQ91ZW7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cd209eQ91ZW7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Cd209eQ91ZW7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cd209eQ91ZW7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cd209eQ91ZW7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cd209eQ91ZW7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cd209eQ91ZW7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cd209eQ91ZW7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cd209eQ91ZW7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cd209eQ91ZW7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cd209eQ91ZW7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Cd209eQ91ZW7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cd209eQ91ZW7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cd209eQ91ZW7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cd209eQ91ZW7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cd209eQ91ZW7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Cd209eQ91ZW7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cd209eQ91ZW7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cd209eQ91ZW7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cd209eQ91ZW7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cd209eQ91ZW7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cd209eQ91ZW7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cd209eQ91ZW7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cd209eQ91ZW7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cd209eQ91ZW7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cd209eQ91ZW7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cd209eQ91ZW7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cd209eQ91ZW7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cd209eQ91ZW7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cd209eQ91ZW7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cd209eQ91ZW7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cd209eQ91ZW7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cd209eQ91ZW7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cd209eQ91ZW7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cd209eQ91ZW7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cd209eQ91ZW7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cd209eQ91ZW7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cd209eQ91ZW7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cd209eQ91ZW7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cd209eQ91ZW7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cd209eQ91ZW7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cd209eQ91ZW7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Cd209eQ91ZW7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Cd209eQ91ZW7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cd209eQ91ZW7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cd209eQ91ZW7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cd209eQ91ZW7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cd209eQ91ZW7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cd209eQ91ZW7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cd209eQ91ZW7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Cd209eQ91ZW7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cd209eQ91ZW7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cd209eQ91ZW7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cd209eQ91ZW7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cd209eQ91ZW7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cd209eQ91ZW7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cd209eQ91ZW7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cd209eQ91ZW7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cd209eQ91ZW7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cd209eQ91ZW7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cd209eQ91ZW7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cd209eQ91ZW7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cd209eQ91ZW7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cd209eQ91ZW7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cd209eQ91ZW7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cd209eQ91ZW7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cd209eQ91ZW7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cd209eQ91ZW7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cd209eQ91ZW7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cd209eQ91ZW7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cd209eQ91ZW7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cd209eQ91ZW7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cd209eQ91ZW7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Cd209eQ91ZW7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cd209eQ91ZW7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cd209eQ91ZW7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cd209eQ91ZW7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cd209eQ91ZW7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cd209eQ91ZW7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cd209eQ91ZW7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cd209eQ91ZW7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cd209eQ91ZW7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cd209eQ91ZW7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cd209eQ91ZW7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cd209eQ91ZW7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cd209eQ91ZW7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cd209eQ91ZW7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cd209eQ91ZW7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cd209eQ91ZW7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms