Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER58

Spock2, Testican-2, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock2Q9ER58 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
Spock2Q9ER58 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Spock2Q9ER58 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Spock2Q9ER58 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Spock2Q9ER58 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Spock2Q9ER58 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Spock2Q9ER58 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Spock2Q9ER58 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Spock2Q9ER58 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Spock2Q9ER58 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Spock2Q9ER58 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Spock2Q9ER58 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Spock2Q9ER58 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Spock2Q9ER58 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Spock2Q9ER58 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Spock2Q9ER58 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Spock2Q9ER58 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Spock2Q9ER58 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Spock2Q9ER58 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Spock2Q9ER58 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Spock2Q9ER58 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Spock2Q9ER58 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Spock2Q9ER58 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Spock2Q9ER58 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Spock2Q9ER58 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Spock2Q9ER58 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Spock2Q9ER58 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Spock2Q9ER58 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Spock2Q9ER58 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Spock2Q9ER58 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Spock2Q9ER58 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Spock2Q9ER58 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Spock2Q9ER58 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Spock2Q9ER58 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Spock2Q9ER58 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Spock2Q9ER58 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Spock2Q9ER58 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Spock2Q9ER58 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Spock2Q9ER58 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Spock2Q9ER58 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Spock2Q9ER58 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Spock2Q9ER58 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Spock2Q9ER58 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Spock2Q9ER58 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Spock2Q9ER58 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Spock2Q9ER58 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Spock2Q9ER58 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Spock2Q9ER58 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Spock2Q9ER58 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Spock2Q9ER58 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Spock2Q9ER58 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Spock2Q9ER58 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Spock2Q9ER58 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Spock2Q9ER58 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Spock2Q9ER58 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Spock2Q9ER58 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Spock2Q9ER58 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Spock2Q9ER58 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Spock2Q9ER58 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Spock2Q9ER58 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Spock2Q9ER58 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Spock2Q9ER58 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Spock2Q9ER58 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Spock2Q9ER58 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Spock2Q9ER58 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Spock2Q9ER58 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Spock2Q9ER58 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Spock2Q9ER58 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Spock2Q9ER58 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Spock2Q9ER58 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Spock2Q9ER58 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Spock2Q9ER58 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Spock2Q9ER58 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Spock2Q9ER58 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Spock2Q9ER58 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Spock2Q9ER58 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Spock2Q9ER58 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Spock2Q9ER58 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Spock2Q9ER58 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Spock2Q9ER58 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Spock2Q9ER58 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Spock2Q9ER58 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Spock2Q9ER58 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Spock2Q9ER58 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Spock2Q9ER58 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Spock2Q9ER58 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Spock2Q9ER58 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Spock2Q9ER58 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Spock2Q9ER58 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Spock2Q9ER58 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Spock2Q9ER58 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Spock2Q9ER58 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Spock2Q9ER58 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Spock2Q9ER58 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Spock2Q9ER58 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Spock2Q9ER58 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Spock2Q9ER58 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Spock2Q9ER58 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Spock2Q9ER58 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Spock2Q9ER58 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms