Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER58

Spock2, Testican-2, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock2Q9ER58 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41,21■■■■■ 4,19
Spock2Q9ER58 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37,91■■■■□ 3,66
Spock2Q9ER58 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,5■■■■□ 3,59
Spock2Q9ER58 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
Spock2Q9ER58 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36,36■■■■□ 3,41
Spock2Q9ER58 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Spock2Q9ER58 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,72■■■■□ 3,31
Spock2Q9ER58 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35,64■■■■□ 3,3
Spock2Q9ER58 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35,6■■■■□ 3,29
Spock2Q9ER58 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Spock2Q9ER58 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Spock2Q9ER58 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Spock2Q9ER58 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34,51■■■■□ 3,12
Spock2Q9ER58 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Spock2Q9ER58 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Spock2Q9ER58 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,28■■■■□ 3,08
Spock2Q9ER58 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Spock2Q9ER58 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,05■■■■□ 3,04
Spock2Q9ER58 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Spock2Q9ER58 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Spock2Q9ER58 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Spock2Q9ER58 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Spock2Q9ER58 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Spock2Q9ER58 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,59■■■□□ 2,97
Spock2Q9ER58 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Spock2Q9ER58 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33,57■■■□□ 2,96
Spock2Q9ER58 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Spock2Q9ER58 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Spock2Q9ER58 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33,27■■■□□ 2,92
Spock2Q9ER58 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Spock2Q9ER58 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,05■■■□□ 2,88
Spock2Q9ER58 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Spock2Q9ER58 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32,82■■■□□ 2,84
Spock2Q9ER58 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Spock2Q9ER58 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Spock2Q9ER58 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Spock2Q9ER58 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,58■■■□□ 2,81
Spock2Q9ER58 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Spock2Q9ER58 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,51■■■□□ 2,79
Spock2Q9ER58 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Spock2Q9ER58 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32,43■■■□□ 2,78
Spock2Q9ER58 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32,42■■■□□ 2,78
Spock2Q9ER58 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Spock2Q9ER58 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Spock2Q9ER58 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,75
Spock2Q9ER58 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Spock2Q9ER58 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Spock2Q9ER58 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,01■■■□□ 2,72
Spock2Q9ER58 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,98■■■□□ 2,71
Spock2Q9ER58 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,97■■■□□ 2,71
Spock2Q9ER58 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Spock2Q9ER58 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31,91■■■□□ 2,7
Spock2Q9ER58 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Spock2Q9ER58 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Spock2Q9ER58 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Spock2Q9ER58 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,75■■■□□ 2,67
Spock2Q9ER58 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Spock2Q9ER58 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31,67■■■□□ 2,66
Spock2Q9ER58 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,65■■■□□ 2,66
Spock2Q9ER58 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,6■■■□□ 2,65
Spock2Q9ER58 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Spock2Q9ER58 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Spock2Q9ER58 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Spock2Q9ER58 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Spock2Q9ER58 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Spock2Q9ER58 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Spock2Q9ER58 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,49■■■□□ 2,63
Spock2Q9ER58 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31,48■■■□□ 2,63
Spock2Q9ER58 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Spock2Q9ER58 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Spock2Q9ER58 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Spock2Q9ER58 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Spock2Q9ER58 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Spock2Q9ER58 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,24■■■□□ 2,59
Spock2Q9ER58 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Spock2Q9ER58 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31,18■■■□□ 2,58
Spock2Q9ER58 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31,18■■■□□ 2,58
Spock2Q9ER58 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,15■■■□□ 2,58
Spock2Q9ER58 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Spock2Q9ER58 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Spock2Q9ER58 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Spock2Q9ER58 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31,01■■■□□ 2,55
Spock2Q9ER58 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Spock2Q9ER58 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,54
Spock2Q9ER58 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30,91■■■□□ 2,54
Spock2Q9ER58 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30,86■■■□□ 2,53
Spock2Q9ER58 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Spock2Q9ER58 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Spock2Q9ER58 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Spock2Q9ER58 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Spock2Q9ER58 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Spock2Q9ER58 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Spock2Q9ER58 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Spock2Q9ER58 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Spock2Q9ER58 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Spock2Q9ER58 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Spock2Q9ER58 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Spock2Q9ER58 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30,54■■■□□ 2,48
Spock2Q9ER58 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,48
Spock2Q9ER58 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,5■■■□□ 2,47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,3 ms