Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
NmbrO54799 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NmbrO54799 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NmbrO54799 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NmbrO54799 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NmbrO54799 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NmbrO54799 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
NmbrO54799 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NmbrO54799 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
NmbrO54799 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
NmbrO54799 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
NmbrO54799 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NmbrO54799 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NmbrO54799 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
NmbrO54799 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NmbrO54799 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NmbrO54799 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NmbrO54799 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NmbrO54799 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NmbrO54799 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NmbrO54799 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NmbrO54799 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NmbrO54799 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
NmbrO54799 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NmbrO54799 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NmbrO54799 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NmbrO54799 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NmbrO54799 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
NmbrO54799 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NmbrO54799 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NmbrO54799 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NmbrO54799 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NmbrO54799 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NmbrO54799 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NmbrO54799 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NmbrO54799 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NmbrO54799 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NmbrO54799 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
NmbrO54799 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NmbrO54799 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NmbrO54799 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NmbrO54799 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NmbrO54799 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NmbrO54799 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NmbrO54799 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NmbrO54799 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NmbrO54799 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NmbrO54799 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NmbrO54799 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NmbrO54799 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NmbrO54799 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NmbrO54799 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NmbrO54799 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NmbrO54799 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NmbrO54799 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NmbrO54799 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NmbrO54799 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NmbrO54799 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NmbrO54799 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NmbrO54799 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NmbrO54799 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NmbrO54799 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NmbrO54799 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NmbrO54799 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NmbrO54799 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NmbrO54799 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NmbrO54799 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NmbrO54799 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NmbrO54799 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NmbrO54799 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NmbrO54799 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NmbrO54799 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NmbrO54799 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NmbrO54799 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NmbrO54799 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NmbrO54799 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NmbrO54799 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NmbrO54799 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NmbrO54799 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NmbrO54799 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NmbrO54799 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NmbrO54799 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NmbrO54799 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NmbrO54799 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NmbrO54799 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NmbrO54799 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NmbrO54799 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NmbrO54799 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NmbrO54799 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NmbrO54799 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NmbrO54799 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NmbrO54799 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NmbrO54799 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NmbrO54799 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NmbrO54799 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NmbrO54799 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NmbrO54799 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NmbrO54799 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NmbrO54799 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NmbrO54799 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms